结论：学校申请回原单位且不想继续借调，这一行为是否合法，主要取决于借调协议的具体内容以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：

1. 借调协议的角度：

   • 协议内容：首先，需要查看借调协议中是否明确规定了借调期限、借调结束后的处理方式等关键条款。如果协议中明确规定了借调期限，并且该期限已经届满，那么学校作为被借调单位，有权要求员工返回原单位，此时不想继续借调是合法的。
   • 协议变更或解除：如果借调期限未满，但学校因特殊原因（如业务调整、人员过剩等）希望提前结束借调，这可能需要与借调单位进行协商，并可能需要承担一定的违约责任，具体取决于协议中的约定。如果双方能够达成一致，那么提前结束借调也是合法的。

2. 法律法规的角度：

   • 劳动法规定：根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，劳动者有权在劳动合同约定的范围内享受劳动权益，包括工作地点、工作内容等。如果借调协议违反了劳动法的相关规定，如未经劳动者同意擅自变更工作地点或工作内容，那么劳动者有权拒绝，并可以要求用人单位承担相应的法律责任。
   • 借调合法性：借调本身是一种合法的用工方式，但必须建立在双方自愿、平等、协商一致的基础上，并且不得违反法律法规的强制性规定。如果借调协议合法有效，且双方均按照协议履行义务，那么学校不想继续借调的行为需要依据协议和法律法规来判断其合法性。

3. 实际操作建议：

   • 沟通协商：如果学校希望结束借调，建议首先与借调单位进行沟通协商，明确双方的权利和义务，尽量达成一致意见。
   • 审查协议：仔细审查借调协议的内容，特别是关于借调期限、借调结束后的处理方式等条款，确保自己的行为符合协议约定。
   • 法律咨询：如果无法与借调单位达成一致意见，或者对协议内容存在疑问，建议咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的法律后果。

可能后果：

• 如果学校未经借调单位同意擅自结束借调，可能会面临违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。
• 如果借调协议违反了法律法规的强制性规定，学校可能会面临劳动行政部门的处罚，如罚款、责令改正等。

总结与建议： 学校申请回原单位且不想继续借调是否合法，需要综合考虑借调协议的具体内容以及相关法律法规的规定。建议学校在做出决定前，先与借调单位进行沟通协商，并仔细审查借调协议的内容。如有需要，可以咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果你有进一步的法律问题或需要更详细的法律咨询，可以直接向我提问。