针对您提出的“公司迟到扣了迟到的钱还扣全勤怎么办”这一问题，以下是我的详细解答：

1. 迟到扣工资与扣全勤的合法性分析：

   • 合法情况：若用人单位的规章制度明确规定了迟到扣工资和全勤奖的条件与标准，且该制度是依据法定程序制定（即经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，同时已向劳动者公示或告知），那么在符合规定情形时，迟到扣工资并扣全勤有一定合法性。
   • 不合法情况：
     • 规章制度不合理，例如迟到几分钟就扣除大量工资，或者扣除工资后劳动者所得低于当地最低工资标准。法律规定，用人单位每月扣除劳动者工资不得超过当月工资的20%，若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
     • 用人单位没有合法有效的规章制度支撑，随意扣工资和全勤奖，属于违法行为。

2. 应对措施：

   • 与单位协商：首先，您可以尝试与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解扣工资和扣全勤的具体依据，并表达您的异议。通过协商，可能能够达成双方都能接受的解决方案。
   • 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉。投诉时，请准备好相关证据，如劳动合同、考勤记录、工资条等，以证明您的劳动关系和工作时间，以及单位的不当扣款行为。
   • 申请劳动仲裁：若投诉后问题仍未得到解决，您可以向劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在仲裁过程中，您需要提交仲裁申请书以及相关证据材料。仲裁委员会受理后会进行审理，并作出裁决。
   • 向法院起诉：若对仲裁结果不满意，您可以在自收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。

3. 注意事项：

   • 在整个过程中，请保持冷静和理性，避免与单位发生不必要的冲突。
   • 妥善保管好所有与工作相关的证据和文件，以备不时之需。
   • 如有需要，可以寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。

综上所述，公司迟到扣了迟到的钱还扣全勤是否合法，需结合具体情况判断。若您认为单位的行为不合法，可以采取上述措施来维护自己的权益。如有任何法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。