员工早退扣工资是否合法，关键在于用人单位的规章制度、扣罚程序及扣罚标准的合理性。以下是对此问题的详细分析：
规章制度明确且合理：
- 用人单位应依法制定内部规章制度，明确规定早退的扣薪标准。这一规章制度需经过民主程序制定，如职工代表大会或全体员工讨论通过，并已向员工公示告知。
- 扣薪标准应公平合理，不能明显侵害劳动者权益，通常应考虑企业实际情况、行业惯例及早退对工作的影响程度。例如，按早退时间占正常工作时长的比例来扣除相应工资，计算公式为：应扣工资 = 月工资收入÷月计薪天数÷每日工作小时数×早退小时数。
劳动合同有约定：
- 若劳动合同中明确约定了早退属于违反合同约定的行为，并规定了相应的扣薪条款，该条款也需公平合理，且不能违反法律法规的强制性规定。
- 劳动合同中的扣薪约定应与规章制度相一致，确保扣罚的合法性和合理性。
扣罚合理：
- 扣工资的额度应当合理，确保扣罚金额与员工的过错相适应。扣除的金额一般不应超出劳动者当月应得薪酬的一定比例（如20%），且扣除后的剩余工资不能低于当地最低工资标准。
- 例如，若员工月工资为5000元，早退1小时，按上述公式计算，应扣工资约为28.74元（5000÷21.75÷8×1，假设月计薪天数为21.75天），这一扣罚金额在合理范围内，且扣除后剩余工资远高于当地最低工资标准，则扣工资行为合法。
若用人单位违反上述条件，扣工资行为则可能不合法：
- 无规章制度或程序不合法：用人单位没有相关规章制度，或规章制度的制定程序不合法（如未经过民主程序、未公示告知），则直接扣工资的行为不合法。
- 扣罚标准过高或不合理：如果扣罚标准过高，导致员工工资大幅减少，甚至影响其基本生活，这种扣工资行为也可能被认定为不合法。
面对不合法的扣工资行为，员工可以采取以下措施维护自己的合法权益：
- 与用人单位协商解决：首先尝试与用人单位沟通，表达异议和诉求，寻求双方都能接受的解决方案。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，员工可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。
综上所述，员工早退扣工资是否合法取决于多个因素的综合考量。用人单位应确保规章制度的合法性、合理性和透明性；员工也应了解自己的权益和维权途径，并在必要时依法维护自己的合法权益。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。