事业单位擅自取消工作人员事业编制且未向当事人书面通知原由是违法的。

首先，从法律程序的角度来看，事业单位在取消工作人员事业编制时，应当遵循一定的法律程序，包括通知当事人、说明理由等。如果事业单位未按照法定程序进行，即构成程序违法。在这个问题中，事业单位擅自取消事业编制且未向当事人书面通知原由，显然违反了法律程序。

其次，从劳动者权益保护的角度来看，事业单位与工作人员之间建立的是劳动关系，事业单位应当保障工作人员的合法权益。擅自取消事业编制且未书面通知原由，侵犯了工作人员的知情权、申诉权等合法权益，违反了劳动者权益保护的相关法律规定。

综上所述，事业单位擅自取消工作人员事业编制且未向当事人书面通知原由是违法的。如果当事人遇到这种情况，可以向事业单位提出质疑，要求事业单位给出合理的解释和补救措施。如果事业单位不予理睬或处理不当，当事人还可以向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。