一般情况下，工厂员工依法辞职，工厂不应扣工资。下面我将从不同情况详细分析这个问题：

1. 依法辞职的情况：

   • 根据相关法律规定，劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，也可以解除劳动合同。
   • 只要员工按照上述规定履行了辞职程序，工厂就应当足额支付其已工作期间的工资。

2. 特殊情况下的扣工资：

   • 如果劳动者因自身原因急辞未提前通知工厂，给工厂造成损失，工厂可要求赔偿，从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%。若扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
   • 如果存在法定情形，如工厂未及时足额支付劳动报酬、未依法为劳动者缴纳社会保险费等，劳动者可以即时解除劳动合同，无需承担赔偿责任，工厂应足额支付工资。

3. 工厂违法扣工资的处理：

   • 如果工厂以员工辞职为由扣工资，属于违法行为。员工首先可以与工厂进行协商，要求其支付足额工资。
   • 协商不成的，员工可以向劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令工厂限期支付工资。逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金。
   • 员工也可以直接向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径解决工资纠纷。

综上所述，工厂员工在依法辞职的情况下，工厂不应扣工资。如果工厂违法扣工资，员工有多种合法途径可以维护自己的权益。如果你在这方面有任何问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。