结论前置：工厂在辞退员工时，一般情况下不会扣钱，且需按照法律规定支付经济补偿金。但在特定情况下，如员工因过错给工厂造成损失或违反相关协议，工厂有权依法从员工工资中扣除相应赔偿或违约金。非法辞退则必须支付赔偿金。
一、合法辞退与工资支付
一般情况不扣钱：
- 根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者工资。因此，当员工因法定情形（如试用期不符合录用条件、严重违反规章制度等）被合法辞退时，工厂应正常结算并支付员工工资，不得无故扣减。
特殊情况可扣钱：
- 赔偿损失：若员工因故意或重大过失给工厂造成经济损失，工厂可按劳动合同约定或相关法律规定要求员工赔偿。赔偿额可从工资中扣除，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，员工因疏忽导致工厂设备损坏，需赔偿5000元，而员工月工资为6000元，则工厂每月最多可从员工工资中扣除1200元（6000元的20%），直至赔偿完毕。
- 违约金：如员工违反了培训服务期协议或竞业限制协议，工厂可依据协议约定要求员工支付违约金，数额需合理且符合法律规定。例如，员工接受了工厂提供的专项培训，并约定了服务期，若员工在服务期内辞职，则需按照约定支付违约金。
经济补偿金支付：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。例如，员工在工厂工作了3年，月工资为5000元，则工厂需支付员工3个月工资作为经济补偿，即15000元。
二、非法辞退与赔偿责任
- 工厂若无合法理由辞退员工，属于违法解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，不仅不能扣钱，还需向员工支付经济补偿，拒不支付的由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。赔偿金标准为经济补偿标准的二倍。例如，员工在工厂工作了3年，月工资为5000元，若工厂非法辞退员工，则需支付员工6个月工资作为赔偿金，即30000元。
三、实践建议与权益保护
确保工资正常结算：
- 劳动者在被辞退时，应确保自己的工资得到正常结算，并关注是否有权获得经济补偿金。若工厂未按时支付工资或经济补偿金，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
了解赔偿与扣款情况：
- 对于可能涉及的赔偿或扣款，劳动者应了解具体情况，确保工厂行为符合法律规定。若工厂要求员工支付赔偿或违约金，劳动者应核实相关协议及损失情况，避免不必要的经济损失。
维护合法权益：
- 若工厂在辞退过程中存在违法行为，如无故扣减工资或拒绝支付经济补偿金，劳动者有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，劳动者需提供相关证据材料，如劳动合同、工资单、辞退通知等。
综上所述，工厂在辞退员工时，应遵循法律规定，确保工资正常支付，并在必要时支付经济补偿金。同时，劳动者也应了解自己的权益，确保在辞退过程中不受不当待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。