针对“员工当天提交离职后旷工怎么处理”的问题，首先需要明确的是，员工提交离职并不等同于已经离职，而是在提出离职申请后，还需要按照公司的规定和流程办理离职手续，并在双方约定的离职日期正式离职。如果员工在提交离职后旷工，公司可以根据具体情况采取以下措施：

一、明确旷工定义与后果

旷工一般是指员工应当提供劳动但无正当理由未提供劳动的缺勤行为。我国现行法律并未明确旷工的具体定义，但实践中，用人单位通常会在规章制度中明确旷工的定义、认定标准及相应的处罚措施。因此，公司应首先查阅自身的规章制度，明确旷工的认定标准和处罚措施。

二、核实旷工事实

1. 考勤记录：公司应首先查看考勤记录，确认员工是否存在旷工行为。但需要注意的是，考勤记录并非唯一证据，还需要结合其他证据进行综合判断。
2. 其他证据：如员工请假记录、工作交接记录、同事证言等，都可以作为判断员工是否旷工的依据。

三、按照规章制度处理

1. 沟通确认：在确认员工旷工后，公司应及时与员工进行沟通，了解旷工原因，并告知其旷工的法律后果和公司的处理决定。
2. 依据规章制度处理：如果公司规章制度中明确规定了旷工的处罚措施，如警告、罚款、解除劳动合同等，公司可以按照规章制度进行处理。但需要注意的是，解除劳动合同等严重处罚措施应谨慎使用，并确保符合法律规定的解除条件。

四、注意法律风险

1. 举证责任：在劳动争议中，用人单位承担举证责任。因此，公司在处理员工旷工问题时，应确保有足够的证据支持其处理决定。
2. 遵守法律规定：公司在处理员工旷工问题时，应遵守相关法律规定，如《劳动合同法》等。如果公司的处理决定违反法律规定，可能会面临法律风险和经济赔偿。

五、特殊情况处理

如果员工在提交离职后旷工，且公司决定解除劳动合同，还需要注意以下几点：

1. 离职手续：即使员工旷工，公司也应按照规定办理离职手续，并结清员工的工资和福利。
2. 经济补偿：如果公司的解除劳动合同决定被认定为违法，公司可能需要向员工支付经济补偿金。

综上所述，员工当天提交离职后旷工，公司应根据具体情况采取相应措施，并确保符合法律规定和公司规章制度。在处理过程中，公司应注重证据的收集和保存，避免法律风险和经济赔偿。