在职期间利用职务给自己牟利，离职两年后一般无法追回。具体分析如下：
法律性质：
- 在职期间利用职务给自己牟利，通常属于违反职业道德或公司规章制度的行为，甚至可能构成犯罪（如贪污、职务侵占等），但这属于公司与员工之间的内部纠纷，或可能涉及刑事责任。
- 离职两年后，该行为已经发生较长时间，且通常这类纠纷的解决会有一定的时效限制。
追回的可能性：
- 如果该行为当时就被发现，公司可能会采取法律手段追回不当得利，并可能对员工进行处罚。
- 但离职两年后，公司很可能已经处理了相关事宜，或者因为时效问题而无法再追回。
- 此外，如果当时没有明确的证据表明员工利用职务之便牟利，现在再追回也会面临证据不足的问题。
法律建议：
- 对于公司而言，应建立健全的内部控制制度，加强对员工行为的监督和管理，及时发现并处理类似问题。
- 对于员工而言，应遵守职业道德和公司规章制度，不要利用职务之便为自己谋取私利。
- 如果现在公司或相关方提出追回要求，建议咨询专业律师，了解具体的法律风险和应对策略。
综上所述，在职期间利用职务给自己牟利3000元，离职两年后一般无法追回。但具体情况还需根据当时的证据、公司规定以及相关法律法规进行综合判断。如果你有其他法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。