对于员工离职多年后发现其之前吃回扣的行为，公司仍然有权进行追诉。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 法律责任不因离职而消除：

   • 员工在职期间吃回扣的行为，属于违法行为，可能涉及商业贿赂，对公司造成了经济损失。尽管员工已经离职，但其违法行为并不会因此而自动消除。公司完全有权通过法律途径来捍卫自己的合法权益，追究该员工的法律责任。

2. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国反不正当竞争法》第七条的规定，经营者不得采用财物或者其他手段贿赂相关单位或个人，以谋取交易机会或者竞争优势。如果员工吃回扣的行为违反了这一规定，公司可以依法追究其责任。
   • 如果情节严重，还可能触犯刑法中的相关罪名，如非国家工作人员受贿罪等。此时，公司不仅可以追究民事责任，还可以向公安机关报案，要求追究员工的刑事责任。

3. 追诉时效：

   • 关于追诉时效，一般来说，民事责任的追诉时效可能因具体情况而异，但通常不会因为员工离职而立即失效。对于刑事责任，根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪行为的追诉时效取决于犯罪的法定最高刑。如果员工吃回扣的行为构成犯罪，且未超过追诉时效，公司仍然可以要求追究其刑事责任。

4. 实际操作建议：

   • 如果公司发现员工离职前有吃回扣的行为，应首先收集相关证据，如财务记录、交易合同、证人证言等。
   • 接着，公司可以咨询专业律师，评估追诉的可行性和风险，并制定相应的追诉策略。
   • 在追诉过程中，公司应积极配合相关部门的调查，提供必要的证据和协助。

综上所述，员工离职多年后发现其之前吃回扣的行为，公司仍然有权进行追诉。公司应依法维护自己的合法权益，追究该员工的法律责任。如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。