即便公司以个人名义发工资，员工也可以通过多种方式证明劳动关系的存在。具体分析如下：

一. 证明劳动关系的关键要素

1. 双方符合劳动法规的主体资格：用人单位和劳动者都需满足法律对于雇佣方和受雇方的资格要求。例如，公司作为用人单位，必须合法注册并具备用工资格；劳动者则需达到法定劳动年龄，具备劳动能力。
2. 劳动者提供的劳动是单位业务的一部分：劳动者需证明其为公司提供的劳动是公司业务不可或缺的组成部分。这可以通过工作内容、工作成果以及公司业务的性质来综合判断。
3. 劳动者遵守公司规章制度：劳动者需证明其在实际工作中遵守了公司的各项规章制度，如考勤制度、工作规范等。这可以通过公司的规章制度文件、劳动者的考勤记录、工作表现评价等来证明。
4. 工资发放记录：尽管工资是以个人名义发放，但工资发放记录本身也是证明劳动关系的重要证据。劳动者可以收集工资条、银行转账记录等，证明工资是由公司（或其法定代表人、股东等关联个人）按时发放。

二. 法律依据

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》第七条：“用人单位自用工之日起即与劳动者建立劳动关系。用人单位应当建立职工名册备查。”这表明，劳动关系的建立并不以签订书面劳动合同为唯一条件，实际用工即可视为劳动关系的建立。
• 同时，该法第三条也强调：“依法订立的劳动合同具有约束力，用人单位与劳动者应当履行劳动合同约定的义务。”这意味着，即使工资以个人名义发放，只要双方实际上履行了劳动关系的权利义务，劳动关系即被视为存在。

三. 实际案例理解

• 例如，某员工在公司工作多年，期间工资一直由公司法定代表人的个人账户发放。在证明劳动关系时，员工提供了多年的工资发放记录、工作成果证明以及公司内部的考勤记录等。最终，法院根据这些证据认定了员工与公司之间存在劳动关系。

综上所述，即便公司以个人名义发工资，员工仍可以通过收集双方符合劳动法规的主体资格证明、劳动者提供劳动是公司业务一部分的证据、遵守公司规章制度的证明以及工资发放记录等证据来证明劳动关系的存在。如有进一步需要，您可以继续咨询我。