针对“入职五六个月就怀孕的员工怎么办”这一问题，首先我们要明确的是，女性员工怀孕是她们的基本权利，且受到法律的保护。以下是对这一问题的详细解答：
一、法律法规基础
根据相关法律法规，女性员工在怀孕、产期、哺乳期等特殊时期享有特殊的劳动保护。具体来说，用人单位不得因女性员工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同，除非有法定事由且经过特定程序。
二、应对措施
沟通理解：
- 首先，用人单位应与怀孕员工进行沟通，了解其身体状况和孕期需求，以便合理安排工作。
- 同时，也应向员工说明公司的相关政策和福利待遇，消除其顾虑。
调整工作岗位：
- 如果怀孕员工的身体状况需要，用人单位可以考虑调整其工作岗位，安排更为轻松、安全的工作，避免高强度或危险性的工作。
提供必要的劳动保护：
- 用人单位应提供必要的劳动保护措施，如改善工作环境、提供防护用品等，以确保怀孕员工的身体健康和安全。
处理薪资和福利问题：
- 怀孕员工在产假期间享有产假工资或生育津贴。用人单位应按照相关法律法规的规定，按时足额支付。
- 同时，用人单位也应关注员工的社保缴纳情况，确保其在孕期和产假期间的社保权益不受影响。
避免歧视和不公平待遇：
- 用人单位应秉持公平、公正的原则，避免对怀孕员工进行歧视或不公平待遇。
- 如果怀孕员工遭遇不公平待遇，可以依法向相关部门投诉或寻求法律援助。
三、注意事项
遵守法律法规：
- 用人单位应严格遵守相关法律法规，保障怀孕员工的合法权益。
- 同时，也应加强内部管理，确保员工在特殊时期的权益得到妥善保护。
关注员工心理健康：
- 除了物质上的支持外，用人单位还应关注怀孕员工的心理健康状况。
- 可以提供心理咨询或辅导服务，帮助员工缓解压力、调整心态。
建立良好企业文化：
- 用人单位应倡导尊重女性、关爱员工的企业文化。
- 通过举办相关活动或培训，提高员工对女性权益的认识和尊重。
综上所述，对于入职五六个月就怀孕的员工，用人单位应给予充分的关注和支持。通过沟通理解、调整工作岗位、提供必要的劳动保护、处理薪资和福利问题以及避免歧视和不公平待遇等措施，确保怀孕员工的合法权益得到妥善保护。同时，用人单位也应加强内部管理、关注员工心理健康并建立良好企业文化，以营造和谐、稳定的劳动关系。