休息日加班工资应按不低于工资的百分之二百的工资报酬来计算，而非劳动者平常的工资。下面是具体的分析：

一. 一般情况下的休息日加班工资计算

1. 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条的规定，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。
2. 计算公式：加班工资 = 月工资基数 ÷ 月计薪天数 × 200% × 加班天数。其中，月工资基数应按照劳动合同约定的劳动者本人工资标准确定，月计薪天数通常为21.75天。
3. 实例说明：假设员工月工资为5000元，在某休息日加班一天且未获补休，其这一天的加班工资就是月工资5000元除以月计薪天数21.75天，再乘以200%，即约为460元。

二. 特殊工作制的情况

1. 不定时工作制：部分特殊岗位可能实行不定时工作制，此制度下劳动者在休息日工作通常不享有加班工资，但需经过劳动行政部门审批。
2. 综合计算工时工作制：在此制度下，若计算周期内总的实际工作时间超过法定标准工作时间，超出部分才视为延长工作时间并支付加班工资。同样，实行此制度也需经劳动行政部门审批。

我建议，劳动者在休息日加班时，应了解自己的工资计算方式，并确保用人单位按照法律规定支付加班工资。如用人单位未按规定支付，劳动者有权要求补发或向劳动监察部门投诉。如有进一步需要，您可以继续咨询我。