休息日加班工资既可以按日计算，也可以按小时计算，具体取决于加班的具体情况以及公司的工时制度。下面我将从不同角度为你详细分析：
一、按小时计算加班工资
法律依据：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条以及劳动部《工资支付暂行规定》第十三条，用人单位在劳动者完成劳动定额或规定的工作任务后，根据实际需要安排劳动者在法定标准工作时间以外工作的，应按照一定标准支付工资。
计算公式：
- 小时工资的计算方式为：月工资收入÷（月计薪天数21.75×8小时）。
- 休息日加班的小时加班工资计算公式为：小时工资×200%×加班小时数（若安排补休，则不需支付）。
实例说明：
- 假设某员工月工资为6000元，在某休息日加班了4小时，其小时工资为34.5元（6000元÷21.75天÷8小时），那么其加班工资为276元（34.5元×200%×4小时）。
二、按日计算加班工资
适用情况：
- 当劳动者在休息日或法定节假日加班，且加班时间较长（如一整天）时，可能会按日计算加班工资。
计算公式：
- 日工资的计算方式为：月工资收入÷月计薪天数（21.75天）。
- 休息日加班的加班工资计算公式为：日工资×200%。
实例说明：
- 假设某员工月工资为5000元，在某休息日加班了1天，其日工资为229.9元（5000元÷21.75天），那么其加班工资为459.8元（229.9元×200%）。
三、特殊工时制度下的加班工资计算
综合计算工时工作制：
- 对于实行综合计算工时工作制的劳动者，其综合计算工作时间超过法定标准工作时间的部分，应视为延长工作时间，并按小时计算加班工资。
不定时工时制度：
- 一般情况下，不定时工时制度下的劳动者不执行上述加班工资计算规定。但在部分地区（如上海、深圳），法定假日加班的不定时工时制人员也有加班费，通常按300%的日工资支付。
四、建议与总结
- 劳动者在与用人单位签订劳动合同时，应明确加班及加班费相关事宜，包括加班工资的计算方式、支付时间等，以保障自身合法权益。
- 对于特殊工时制度下的加班工资计算，劳动者应了解并遵循当地法律法规的具体规定。
- 如果遇到加班工资计算或支付方面的问题，劳动者可以及时向用人单位提出异议，并寻求法律帮助。
希望以上分析能对你有所帮助。如果你还有其他关于劳动工伤方面的问题，欢迎直接向我咨询。