如果公司部门合并导致调岗，而员工不同意调岗，是否有赔偿需根据具体情况分析。以下是详细的分析和结论：
调岗的合法性与合理性：
- 若公司基于生产经营的合理需要调岗，且调岗后工资待遇等劳动条件不降低，这属于用人单位的用工自主权范畴。在此情况下，员工拒绝合理调岗，可能构成违反公司规章制度，公司解除合同可能无需支付经济补偿。
- 若调岗不合理，例如明显增加工作强度、降低工资待遇、跨市变动工作地点或具有侮辱性、惩罚性等，这属于变更劳动合同的行为。依据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位变更劳动合同需与劳动者协商一致。若员工不同意这种不合理调岗，公司解除劳动合同，就应当向员工支付经济补偿。
经济补偿的标准：
- 若公司因员工不同意不合理调岗而解除劳动合同，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限计算，每满一年支付一个月工资。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
法律途径：
- 若员工认为调岗不合理且公司拒绝提供补偿，员工可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求撤销调岗决定、恢复待遇及赔偿工资损失等。
- 对仲裁裁决不满的，员工还可以向人民法院提起诉讼，进一步维护自身权益。
综上所述，公司部门合并导致的调岗问题，员工是否有权获得赔偿取决于调岗的合法性与合理性。若调岗合理且劳动条件不降低，员工拒绝可能无赔偿；若调岗不合理且公司因此解除劳动合同，员工则有权获得经济补偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。