工厂跨部门调岗是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度为你详细分析：

合法调岗的情形

1. 双方协商一致
   • 根据《劳动合同法》第三十五条规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工作岗位。如果工厂与员工就跨部门调岗事宜进行了充分沟通，员工同意调岗，并签订了书面的变更劳动合同协议，那么这种调岗就是合法的。例如，工厂因业务拓展需要，将一名从事生产工作的员工调至销售部门，与员工友好协商后，员工认可新的岗位安排，双方签订变更协议，这种情况下调岗合法有效。
2. 符合法定情形
   • 劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作：如果员工因患病或非因工负伤，医疗期满后无法再胜任原部门的工作，工厂为了合理安排工作，将其调至其他部门相对适合的岗位，且该调岗具有合理性，比如从高强度的生产岗位调至相对轻松的后勤岗位，这种调岗是合法的。
   • 劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作：当员工在当前部门的工作表现无法达到岗位要求，经过工厂组织的培训或者调整一次工作岗位后，仍然不能胜任工作时，工厂可以再次将其调至其他部门合适的岗位。例如，一名员工在技术部门多次无法完成技术任务，经过培训后仍无改进，工厂将其调至对技术要求相对较低的质检部门，若该调岗合理，就是合法的。
   • 劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议：这里的客观情况重大变化可能包括工厂进行重大技术改造、业务转型等。比如工厂从传统制造业向智能制造转型，原生产部门大量岗位被自动化设备取代，工厂与员工协商调岗至新成立的智能设备维护部门，若协商不成，工厂在符合一定程序和条件的情况下进行调岗，也是合法的。

非法调岗的情形

1. 未经劳动者同意强行调岗
   • 如果工厂没有与员工进行充分协商，也没有出现上述法定可以调岗的情形，就单方面强行将员工调至其他部门，这种行为是违法的。例如，工厂领导出于个人喜好，未经员工同意，随意将员工从熟悉的部门调至不熟悉的部门，且没有合理的理由，员工有权拒绝这种调岗安排。
2. 调岗具有侮辱性或惩罚性
   • 若工厂调岗的目的是为了对员工进行侮辱或者惩罚，而不是基于生产经营的合理需要，那么这种调岗也是非法的。比如，员工与领导发生了一点小矛盾，领导为了报复员工，将其从重要的业务部门调至清洁部门，这种调岗明显具有惩罚性，违反了法律规定。
3. 调岗后劳动条件明显降低
   • 如果调岗后员工的工作环境、工作时间、劳动报酬等劳动条件明显比原岗位差，且工厂没有合理的理由，这种调岗也是不合法的。例如，员工原岗位工资较高且工作环境舒适，工厂将其调至工资低、工作环境恶劣的部门，又没有合理的生产经营需要作为支撑，员工可以拒绝调岗。

员工面对非法调岗的应对措施

1. 与工厂协商
   • 员工可以先与工厂的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确表达自己对调岗的异议，要求工厂说明调岗的理由和依据。在协商过程中，员工要注意保留好相关的沟通记录，如聊天记录、邮件等。
2. 向劳动监察部门投诉
   • 如果协商无果，员工可以向当地的劳动监察部门投诉，劳动监察部门会依法对工厂的调岗行为进行调查处理。投诉时，员工需要提供相关的证据材料，如劳动合同、调岗通知、沟通记录等。
3. 申请劳动仲裁
   • 员工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，要求确认工厂的调岗行为违法，并要求工厂恢复原岗位或者给予相应的赔偿。在申请劳动仲裁时，员工需要提交仲裁申请书、证据材料等，按照仲裁委员会的要求参加仲裁庭审。

如果你遇到工厂跨部门调岗的情况，不确定是否合法，或者已经遭遇了非法调岗，都可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供详细的法律建议和解决方案。