面对工资实际为5000元但合同中仅标注为2000元的情况，这确实是一个需要谨慎处理的问题，因为它直接关系到您的合法权益。以下是我为您提供的详细分析和应对建议：

一、风险分析

1. 工资发放风险：合同上明确写的工资是2000元，如果用人单位不按照口头约定的5000元发放工资，您在维权时可能会面临困难。因为劳动仲裁机构或法院在缺乏充分证据的情况下，通常会以书面劳动合同约定的工资为准。

2. 社保缴纳风险：用人单位可能会按照合同上的2000元作为基数来缴纳社会保险和住房公积金，这将导致您的社保权益受损，比如养老金待遇降低、医保报销额度减少等。

3. 经济补偿计算风险：在解除劳动合同等需要支付经济补偿的情况下，经济补偿通常按劳动者工资计算。如果合同工资与实际工资不符，经济补偿的计算基数可能会按合同上的2000元确定，这将使您获得的经济补偿大幅减少。

4. 公司违法风险：公司此举可能涉嫌逃税或规避法律责任，属于违法行为。与这样的公司合作，您的权益难以得到保障。

二、应对建议

1. 保留关键证据：

   • 收集并保留能够证明实际工资为5000元的各类证据，如银行工资流水明细、电子支付记录（微信、支付宝转账截图及备注）、工作沟通记录（与上级或人力资源部门的聊天记录、电子邮件）、工资条等。

2. 与用人单位协商：

   • 在收集了充分证据后，尝试与用人单位进行友好协商，要求其更正合同中的薪资条款。可以通过面谈或书面致函的方式提出更正要求，并出示相关证据。

3. 向劳动监察部门投诉：

   • 如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉。投诉时需准备劳动合同、工资支付记录、工作沟通记录等材料的原件和复印件，并填写投诉登记表详细说明情况。

4. 申请劳动仲裁：

   • 如果劳动监察部门的处理未能满足您的诉求，您可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。提交仲裁申请时，需明确仲裁请求（如要求支付工资差额、补缴社会保险等），并附上相关证据材料。

5. 法律诉讼：

   • 若对仲裁裁决结果不满意，您还可以在规定期限内向人民法院提起诉讼，通过司法途径进一步维护自己的合法权益。

三、注意事项

• 在处理此类问题时，请保持冷静理性，避免采取过激行为。
• 充分了解相关法律法规和程序，以便更好地维护自己的权益。
• 及时采取行动，发现实际工资与合同工资不符时，应尽快采取措施，以免错过维权时机。

综上所述，面对工资实际为5000元但合同中仅标注为2000元的情况，您应通过保留证据、与用人单位协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁乃至提起法律诉讼等途径来维护自己的合法权益。希望这些建议能对您有所帮助。