针对您月薪5000但劳动合同却写2000的情况，我的结论是：您应当积极采取措施维护自身权益，避免因此遭受不必要的损失。 以下是从不同角度为您详细分析的情况及建议：
风险分析
工资发放风险：
- 合同上明确写的工资是2000元，若用人单位不按照口头约定的5000元发放工资，您在维权时将面临困难。因为劳动仲裁机构或法院在缺乏充分证据的情况下，通常会以书面劳动合同约定的工资为准。
社保缴纳风险：
- 用人单位可能按合同上的2000元作为基数缴纳社会保险和住房公积金，这将导致您的社保权益受损，如养老金待遇降低、医保报销额度减少等。
经济补偿计算风险：
- 在解除劳动合同等需要支付经济补偿的情况下，经济补偿通常按劳动者工资计算。若合同工资与实际工资不符，经济补偿的计算基数可能按合同上的2000元确定，使您获得的经济补偿大幅减少。
公司违法风险：
- 公司此举可能涉嫌逃税或规避法律责任，属于违法行为。与这样的公司合作，您的权益难以得到保障。
应对建议
协商修改合同：
- 立即行动：与用人单位进行坦诚沟通，明确表达您对合同工资与实际工资不符的担忧，并要求修改劳动合同，明确实际工资为5000元。
- 补充协议：如果用人单位不愿意直接修改合同，您可以要求签订补充协议，详细约定工资构成和发放方式，确保您的权益得到保障。
保留证据：
- 书面说明：如决定签订原合同，应要求用人单位出具关于剩余工资发放方式、金额的书面说明，并加盖公章，作为日后维权的证据。
- 其他证据：保留工资发放记录（如银行转账记录）、考勤记录、工作证、与用人单位的聊天记录等能够证明实际工资水平的证据。
法律途径：
- 咨询与援助：如果用人单位坚持不合理条款且不愿协商，您可以向我咨询，了解自身权益并寻求法律援助。
- 投诉举报：您还可以向当地劳动监察部门投诉举报用人单位的违法行为，维护自己的合法权益。
选择正规公司：
- 在未来的求职过程中，您应优先选择信誉良好、管理规范的公司，以降低遭遇此类风险的可能性。
实际操作中的注意事项
- 及时沟通：一旦发现合同问题，应尽快与用人单位沟通，避免问题恶化。
- 保持冷静：在沟通过程中，保持冷静和理性，避免情绪化行为影响沟通效果。
- 记录沟通：如果可能的话，记录与用人单位的沟通过程，包括时间、地点、参与人员、沟通内容等，以备不时之需。
总之，面对工资实际为5000元但合同只写2000元的情况，您应当坚决维护自身权益，通过协商、保留证据和寻求法律援助等方式确保自己的合法权益得到有效保障。 如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。