结论前置：关于“已签两年了，第三年要签固定劳动合同吗合法吗”的问题，其合法性主要取决于劳动者是否符合签订无固定期限劳动合同的条件以及双方的协商结果。
劳动者不具备签订无固定期限劳动合同条件的情况：
- 在劳动者不具备签订无固定期限劳动合同法定条件（如连续工作未满十年等）的情况下，根据《中华人民共和国劳动合同法》第十三条的规定，用人单位与劳动者可以协商一致，签订固定期限的劳动合同，包括两年期限的合同。这种情况下，签订两年合同是合法的，因为双方是在平等自愿、协商一致的基础上达成协议的。
劳动者具备签订无固定期限劳动合同条件的情况：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第十四条的规定，如果劳动者符合以下任一条件，且没有《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条和第四十条第一项、第二项规定的情形，续订劳动合同时，除劳动者提出订立固定期限劳动合同外，应当订立无固定期限劳动合同：
- 劳动者在该用人单位连续工作满十年的；
- 用人单位初次实行劳动合同制度或者国有企业改制重新订立劳动合同时，劳动者在该用人单位连续工作满十年且距法定退休年龄不足十年的；
- 连续订立二次固定期限劳动合同，且劳动者没有本法第三十九条和第四十条第一项、第二项规定的情形，续订劳动合同的。
- 在劳动者符合上述条件且未提出订立固定期限劳动合同的情况下，用人单位有义务与其签订无固定期限劳动合同。如果用人单位仍然选择签订两年固定期限劳动合同，这将违反《中华人民共和国劳动合同法》的规定，可能面临法律责任，如支付经济补偿等。
实际操作中的注意事项：
- 协商一致：无论劳动者是否符合签订无固定期限劳动合同的条件，双方都应遵循平等自愿、协商一致的原则签订劳动合同。
- 法律合规：用人单位在签订劳动合同时应确保符合法律法规的要求，特别是关于无固定期限劳动合同的规定，避免违法行为带来的法律责任。
- 证据留存：为防范可能的纠纷，用人单位应妥善保存与劳动者签订劳动合同的相关证据，如合同文本、协商记录等，以便在发生争议时提供证明。
法律背景与建议：
- 劳动合同的签订是用人单位与劳动者之间建立劳动关系的重要环节，必须遵循法律法规的规定。在签订劳动合同时，双方应充分了解各自的权利和义务，确保合同的合法性和有效性。
- 对于劳动者而言，如果符合签订无固定期限劳动合同的条件，应积极主张自己的权益，要求用人单位签订无固定期限劳动合同。如果用人单位拒绝或提出不合理条件，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于用人单位而言，应严格遵守《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，确保劳动合同的签订合法合规。在签订劳动合同时，应与劳动者充分协商，明确合同期限、工作内容、劳动报酬等关键条款，避免后续纠纷的发生。
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