针对您提出的“擅自改变厂房使用性质怎么处罚”的问题，这是一个涉及法律法规的复杂问题，我将结合相关法律条款和常见处理措施，为您详细解答。
一、明确结论：
擅自改变厂房使用性质是违法的行为，可能会面临一系列法律后果，包括但不限于责令限期改正、罚款、恢复原状、吊销相关证照，甚至可能承担刑事责任。
二、具体处罚措施：
责令限期改正：
- 相关行政部门（如房地产管理部门、规划部门）在发现擅自改变厂房使用性质的行为后，会向责任人下达责令限期改正通知书。
- 责任人需在规定时间内将厂房恢复至原使用性质，以维护土地利用规划和市场秩序。
罚款：
- 根据违法情节的严重程度、改变用途的面积以及当地经济发展水平等因素，责任人可能面临一定数额的罚款。
- 罚款的具体金额将由相关行政部门根据法律法规和实际情况进行裁定。
恢复原状：
- 若改变厂房使用性质的行为影响了房屋结构或消防安全，行政部门有权要求责任人采取措施恢复厂房原状。
- 这可能包括拆除擅自搭建的设施、恢复原本规划布局等。
吊销相关证照：
- 以擅自改变用途的厂房为经营场所的企业或个体工商户，相关部门可依法吊销其营业执照等经营证照。
- 这将直接影响企业的正常运营和个体的经营活动。
刑事责任：
- 对于情节特别严重或造成严重后果的违法行为，责任人可能还会面临刑事责任的追究。
- 这可能包括有期徒刑、罚金等刑事处罚。
三、对厂房产权和使用权的影响：
- 擅自改变厂房使用性质不仅可能面临上述行政处罚，还可能对厂房的产权和使用权造成长远影响。
- 在厂房转让、出租或申请抵押贷款时，因用途不符可能导致交易受阻或价值降低。
四、建议与指导：
- 在使用厂房时，任何单位或个人都应严格遵守相关法律法规，不得擅自改变厂房使用性质。
- 如需改变厂房使用性质，应按照法定程序向相关部门提出申请，并获得批准后再进行实施。
- 若已擅自改变厂房使用性质，应尽快采取措施恢复厂房原状，以避免不必要的法律风险和经济损失。
- 同时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见和指导，确保自身行为的合法性。
综上所述，擅自改变厂房使用性质是违法的行为，可能面临严重的法律后果。因此，我强烈建议您在使用厂房时严格遵守相关法律法规，确保厂房使用性质的合法性和合规性。