结论：主动离职时，对于未休的年假，公司不可以与员工协商不按3倍（实际为额外2倍，因包含正常工资）的标准支付未休年假工资，除非员工因个人原因且书面提出不休年假。
详细分析：
年休假工资的法定标准：
- 根据《企业职工带薪年休假实施办法》第十条，用人单位若经职工同意不安排年休假或安排的年休假天数少于应休天数，应在本年度内按照职工日工资收入的300%支付未休年休假工资报酬。这300%中，包含了职工正常工作期间的工资收入，因此，在已发放正常工资的基础上，用人单位需额外支付200%的工资作为未休年假的补偿。
员工主动离职与未休年假工资：
- 当员工主动离职时，如果存在未休的年假，用人单位仍需按照上述法定标准支付未休年假工资。这是因为年休假是员工的法定权利，用人单位不能因员工离职而剥夺这一权利或降低补偿标准。
员工书面提出不休年假的特殊情况：
- 如果员工因个人原因（如自愿选择不休、已自行安排其他休息时间等）且书面提出不休年假，那么用人单位可以只支付其正常工作期间的工资收入，而无需额外支付未休年假的补偿。但这种情况需要员工明确、书面地表示放弃年假，且用人单位需保留好相关证据。
协商不按3倍支付的可能性：
- 在一般情况下，公司不可以与员工协商不按3倍（额外2倍）的标准支付未休年假工资。因为这一标准是由法律明确规定的，用人单位必须遵守。如果用人单位试图通过协商降低补偿标准，可能面临法律风险和劳动纠纷。
建议与注意事项：
- 对于员工：在离职前，应了解自己的年假情况，包括已休和未休的年假天数。如果存在未休的年假，应与用人单位沟通并确认补偿标准。如果用人单位试图降低补偿标准，可以明确拒绝并寻求法律援助。
- 对于用人单位：应严格遵守相关法律法规，按照法定标准支付未休年假工资。如果员工因个人原因书面提出不休年假，应保留好相关证据以避免未来可能的法律纠纷。同时，用人单位可以在规章制度中明确年假的安排和补偿标准，以便员工了解和遵守。
示例计算：
假设员工的日工资为500元，未休年假天数为5天。那么，用人单位需支付的未休年假工资为：5天 × 500元/天 × 200%（额外补偿）= 5000元（加上已发放的正常工资，总补偿为7500元，即5天 × 500元/天 × 300%）。
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