结论前置：员工主动辞职且办完手续后，单位是否需支付补偿取决于具体情况。若单位存在过错或员工因特殊原因无法继续工作，单位需依法支付经济补偿；若员工因个人原因主动辞职且单位无过错，则单位无需支付补偿。
一、单位存在过错的情形
在以下情况下，即使员工主动辞职，单位也需支付经济补偿：
未提供约定劳动条件：如劳动合同中明确约定的工作地点、工作环境等被单位擅自改变，导致员工不得不辞职，单位需承担补偿责任。例如，单位未经员工同意，将工作地点从市区变更至郊区，且未提供交通补贴等补偿措施，员工因此辞职，单位需支付经济补偿。
未及时足额支付劳动报酬：单位经常拖延工资发放时间，或未按合同约定的工资标准足额支付，员工以此为由辞职，有权要求单位支付经济补偿。例如，单位连续三个月未按时发放工资，员工提出辞职并要求单位支付拖欠的工资及经济补偿。
未依法缴纳社会保险费：单位未按照法律规定为员工缴纳社会保险，员工因此主动辞职，可要求单位给予经济补偿。例如，单位未为员工缴纳养老保险，员工在达到退休年龄时发现无法享受养老保险待遇，因此提出辞职并要求单位支付经济补偿。
规章制度违法损害劳动者权益：单位的规章制度违反法律法规，严重损害员工权益（如高额罚款、不合理工作时间等），员工辞职可获得补偿。例如，单位规定员工迟到一次罚款500元，该规定明显违反法律法规，员工因此辞职并要求单位支付经济补偿。
欺诈、胁迫订立或变更劳动合同：单位以欺诈、胁迫手段或乘人之危，使员工在违背真实意思的情况下订立或变更劳动合同，员工发现后辞职，单位需支付补偿。例如，单位在招聘时承诺提供高薪和良好工作环境，但员工入职后发现实际待遇与承诺不符，且单位以不签合同就解雇相威胁，员工因此辞职并要求单位支付经济补偿。
二、劳动者因特殊原因无法继续工作的情形
除了单位存在过错外，以下特殊情况也会导致单位需支付经济补偿：
患病或非因工负伤：员工患病或非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事单位另行安排的工作，此时辞职可获得经济补偿。例如，员工因患重病需要长期治疗，医疗期满后无法继续从事原工作，单位也未提供其他合适的工作岗位，员工因此辞职并要求单位支付经济补偿。
不能胜任工作：员工不能胜任工作，经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任，选择辞职时也有权要求单位支付经济补偿。例如，员工因技能不足无法胜任当前工作，单位提供了培训机会但员工仍无法达到工作要求，员工因此辞职并要求单位支付经济补偿。
三、经济补偿的计算方法
经济补偿按员工在本单位工作的年限计算，具体标准如下：
其中，“月工资”指员工在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。计算公式为：
[ \text{经济补偿} = \text{工作年限} \times \text{月工资} ]
（工作年限不满六个月的按0.5个月计算，六个月以上不满一年的按1个月计算，以此类推）
四、注意事项
总结与建议：员工主动辞职后单位是否需支付补偿，需根据具体情况判断。若您面临此类情况，建议先与单位沟通协商，明确辞职原因及补偿事宜。若协商无果，可收集相关证据（如劳动合同、工资条、社保缴纳记录等），向当地劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，以维护自身合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。