结论：关于“年度工作量超1个补20元，欠一个扣100元”是否合法，这主要取决于该规定是否违反了法律法规的强制性规定，以及是否合理、公平地设定了员工的权利和义务。一般情况下，若该规定未违反法律法规，且双方协商一致，可能是合法的；但若存在违法情形或显失公平，则可能不合法。以下从几个方面进行详细分析：
一、合法性判断依据
劳动合同法的相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位与劳动者订立的劳动合同应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。
- 劳动合同中约定的劳动报酬、工作时间、休息休假等条款，应当符合国家法律法规的规定，不得违反法律法规的强制性规定。
工资支付的相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》及《工资支付暂行规定》等法律法规，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 工资支付应当遵循按劳分配的原则，实行同工同酬，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
二、具体分析
若规定合法的情况：
- 如果该规定是用人单位与劳动者在平等自愿、协商一致的基础上订立的，且该规定不违反国家法律法规的强制性规定，如最低工资标准、加班工资支付等，那么该规定可能是合法的。
- 例如，如果用人单位与劳动者约定，在完成基本工作任务的基础上，每超额完成一个工作量，给予20元的奖励；同时，如果劳动者未完成约定的工作量，按照约定扣除相应的工资（但扣除后的工资不得低于当地最低工资标准），且该约定在劳动合同中有明确体现，那么这种规定可能是合法的。
若规定不合法的情况：
- 如果该规定违反了国家法律法规的强制性规定，如扣除工资后的数额低于当地最低工资标准，或者该规定显失公平，如超额完成的奖励远低于未完成的扣除，那么该规定可能是不合法的。
- 例如，如果用人单位规定，无论劳动者是否完成基本工作任务，只要未达到某个高标准，就扣除大量工资，而超额完成的奖励却微不足道，这种规定可能因显失公平而被认定为不合法。
三、建议与风险提示
对于劳动者：
- 在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资支付、工作量考核等方面的规定，确保自己的权益不受侵害。
- 如果对合同条款有疑问或不满，应及时与用人单位沟通协商，必要时可以寻求法律援助或向劳动监察部门投诉。
对于用人单位：
- 在制定规章制度或劳动合同条款时，应遵循合法、公平、合理的原则，确保不违反国家法律法规的强制性规定。
- 应充分考虑劳动者的实际情况和合理诉求，避免设定过于苛刻或不合理的考核标准或处罚措施。
最后，关于“年度工作量超1个补20元，欠一个扣100元”是否合法，不能一概而论，而需要根据具体情况进行判断。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。