结论前置：扣20%工资年底发放是否合法，需根据具体情况判断，一般来说，这种做法可能涉嫌违法，但也有一些特殊情况可能被视为合法。以下我将从多个角度详细分析这一问题。
一、一般情况下的违法性分析
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。这意味着，用人单位应当按时足额支付劳动者的工资，不得随意扣减或延迟发放。
如果用人单位无故扣减劳动者20%的工资，并计划在年底发放，这种做法很可能违反了上述法律规定。因为工资是劳动者劳动的直接回报，用人单位无权随意扣减或延迟支付，除非有合法的理由和依据。
二、可能合法的特殊情况
尽管一般情况下扣减工资年底发放是违法的，但也存在一些特殊情况可能被视为合法。例如：
双方协商一致：如果用人单位与劳动者在劳动合同中明确约定了工资的支付方式，包括扣减部分工资并在年底发放，且这种约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种做法可能是合法的。但需要注意的是，这种约定必须是在双方平等自愿、协商一致的基础上达成的，且不得损害劳动者的合法权益。
法定扣减情形：根据相关法律法规的规定，用人单位在某些特定情况下可以扣减劳动者的工资，如代扣代缴个人所得税、社会保险费等。但这些扣减必须符合法律法规的规定，且不得超过法定的比例和限额。如果用人单位扣减的20%工资属于这些法定扣减情形之一，且扣减比例和限额符合法律规定，那么这种做法可能是合法的。但年底发放的部分仍需确保不违反按月支付工资的原则。
绩效考核与奖金制度：如果用人单位实行的是绩效考核与奖金制度，且扣减的20%工资实际上是属于奖金或绩效工资的一部分，那么根据用人单位的规章制度和劳动合同的约定，这种做法可能是合法的。但同样需要确保这些规章制度和劳动合同的约定不违反法律法规的强制性规定，且已经向劳动者进行了充分的告知和说明。不过，即便属于奖金或绩效工资，也建议用人单位按月或按季度进行核算与发放，以避免年底一次性发放可能带来的法律风险。
三、法律建议与风险提示
对于劳动者：如果用人单位无故扣减你的工资并计划在年底发放，你有权要求用人单位按时足额支付工资。如果用人单位拒绝支付或拖延支付，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
对于用人单位：建议用人单位严格遵守相关法律法规的规定，按时足额支付劳动者的工资。如果确实需要扣减部分工资并在年底发放（如基于双方协商一致或法定扣减情形），请确保这种做法符合法律法规的强制性规定，并已经向劳动者进行了充分的告知和说明。同时，建议用人单位考虑按月或按季度进行工资的核算与发放，以降低法律风险。
最后，劳动法律问题往往涉及复杂的法律关系和事实认定，如果你对这一问题仍有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和解决方案。