结论：企业规定上班超过15或30分钟扣款50元是否合法，需根据具体情况判断，若该规定未经民主程序制定、未公示或扣款金额超出合理范围，则可能不合法。以下从多个角度详细分析：

一、企业规章制度的合法性基础

根据《劳动合同法》第四条，企业制定规章制度需满足以下条件：

1. 民主程序：规章制度需经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或职工代表平等协商确定。
2. 公示告知：规章制度需通过培训、签字确认、邮件通知等方式向劳动者公示，确保劳动者知悉。
3. 内容合法：规章制度不得违反法律、法规的强制性规定，如不得克扣工资、侵犯劳动者权益等。

若企业未履行上述程序，或规章制度内容违法，则该规定无效，企业不得据此扣款。

二、扣款金额的合理性判断

即使规章制度合法，扣款金额也需符合以下原则：

1. 不得超过法定比例：根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者原因造成经济损失的，企业可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
   • 示例：若劳动者月工资为3000元，企业每月最多可扣600元（3000×20%）。若扣款50元，需结合具体工资水平判断是否合理。
2. 不得变相克扣工资：迟到扣款需与实际损失挂钩，如因迟到导致企业额外支出（如加班费、客户赔偿等）。若扣款金额明显高于实际损失，可能被认定为变相克扣工资。
   • 示例：若劳动者迟到15分钟，企业未产生实际损失，却扣款50元，可能不合法。

三、地方性规定的补充

部分地区对迟到扣款有更严格的规定，例如：

• 上海：根据《上海市企业工资支付办法》，企业不得以迟到为由克扣工资，但可按规章制度扣除全勤奖或绩效工资。
• 广东：根据《广东省劳动保障监察条例》，企业扣款需与劳动者协商一致，且不得超过当月工资的20%。

建议劳动者查询当地劳动保障部门的规定，或直接向我咨询具体地区的政策。

四、劳动者的维权途径

若企业扣款不合法，劳动者可采取以下措施：

1. 与企业协商：要求企业出示规章制度，核对制定程序和扣款依据。
2. 向劳动监察部门投诉：拨打12333或通过当地人社局官网举报企业违法行为。
3. 申请劳动仲裁：若投诉无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求企业返还扣款并赔偿损失。

五、给企业的合规建议

为避免法律风险，企业应：

1. 完善规章制度：确保制度经民主程序制定、公示，并明确扣款条件和标准。
2. 合理设定扣款金额：扣款需与实际损失挂钩，避免过高或过低。
3. 保留证据：如因劳动者迟到导致企业损失，需保留相关证据（如客户投诉记录、加班费支付凭证等）。

总结：企业规定上班超过15或30分钟扣款50元是否合法，需结合规章制度制定程序、扣款金额合理性及地方性规定综合判断。若您遇到类似问题，可直接向我咨询，我会根据具体情况为您提供详细解答。