关于您提出的“公司规定上班迟到超过15分钟罚款50元是否合法”的问题，这确实是一个涉及劳动法律法规的复杂议题。以下是我为您详细分析后的解答：

一、一般情况下的不合法性

首先，我们需要明确的是，在我国，罚款属于行政处罚权的一种，其实施主体通常是行政机关。企业，作为市场主体，并不具备法律赋予的罚款权力。因此，如果公司直接以罚款的形式对迟到的员工进行经济处罚，这在法律上通常是缺乏明确依据的。

此外，《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等劳动相关法律法规，也并未明确赋予用人单位对员工进行罚款的权利。这意味着，用人单位不能随意以罚款作为对员工迟到的惩罚措施，否则可能面临法律风险。

二、特殊情况下的合法性探讨

然而，在特定条件下，公司关于迟到扣工资的制度可能被认定为合法。这主要取决于以下两个关键因素：

1. 民主程序制定并公示：

   • 用人单位在制定涉及劳动报酬、工作时间、休息休假等直接涉及劳动者切身利益的规章制度时，应当遵循民主程序。这包括经过职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定，并将该规章制度进行公示或者告知劳动者。
   • 如果公司关于迟到扣工资的制度是通过上述民主程序制定，并且已经向员工进行了公示或告知，那么在程序上，这一制度是合法的。

2. 扣减工资的合理性：

   • 根据《工资支付暂行规定》，如果因劳动者本人原因给用人单位造成了经济损失，用人单位可以按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。但这里有一个重要的限制条件，即扣除的工资部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
   • 如果公司能够证明员工迟到确实给其造成了经济损失，并且扣减的工资数额在上述合理范围内，那么这种“罚款”行为（实际上更准确地说是工资扣减）有可能被认定为合法。

三、劳动者权益保护建议

如果您认为公司的罚款行为侵犯了您的合法权益，您可以采取以下措施来维护自己的权益：

• 协商解决：首先，您可以尝试与公司进行协商，寻求一个合理的解决方案。
• 投诉举报：如果协商不成，您可以向当地的劳动监察部门投诉举报，请求其介入调查并处理。
• 申请仲裁：如果投诉举报未能解决问题，您还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。

综上所述，公司制度规定员工迟到一次罚款50元的合法性并非绝对，而是需要根据具体情况进行判断。公司在制定相关规章制度时，应确保符合法律法规的要求，并充分保障劳动者的合法权益。如果您对此有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。