公司迟到罚50元是否违法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、不违法的情况
存在合法有效的规章制度：
- 制定程序合法：公司若制定了关于考勤和迟到的规章制度，且该制度经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，那么该制度在程序上是合法的。例如，公司通过民主程序制定了详细的考勤管理办法，其中明确规定了迟到的处罚标准。
- 内容合理：规章制度中规定的迟到处罚标准（如迟到一次扣50元）应在合理范围内，与员工给企业造成的经济损失或影响程度相匹配，并考虑员工的工资水平。若员工月工资较高，扣除50元作为惩戒通常被认为是合理的。
- 公示与告知：公司应将规章制度进行公示或告知劳动者，如通过公司公告栏张贴、内部办公系统发布、组织员工培训学习并签字确认等方式，确保员工知晓并同意相关制度。
员工同意：
- 如果员工在签订劳动合同时已明确知晓并同意相关规章制度，包括迟到的处罚标准，那么公司按照规章制度执行扣款行为，通常不被视为违法。
二、违法的情况
无相关规章制度或未履行合法程序：
- 如果公司没有制定关于迟到扣款的规章制度，或者虽有制度但未经过合法的制定和公示程序，那么随意以迟到为由扣员工50元工资就是违法的。
规章制度不合理：
- 即使公司有合法制定和公示的规章制度，但如果迟到扣50元的标准明显过高，对员工造成了不合理的经济负担，也可能被认定为违反劳动法。例如，对于低薪员工而言，高额的扣款可能构成不合理的经济压力。
违反最低工资标准：
- 如果因多次迟到导致扣除的工资数额较大，使得员工当月实际领取的工资低于当地最低工资标准，那么这种扣除行为也是违法的。公司支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。
三、劳动者权益保护
如果劳动者认为公司的迟到扣款行为侵犯了自己的合法权益，可以采取以下措施维护自己的权益：
- 协商解决：首先尝试与公司进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
- 申请劳动仲裁：如果投诉未能解决问题，劳动者还可以依法申请劳动仲裁，通过法律途径来维护自己的合法权益。
总结来说，公司迟到罚50元是否违法，取决于公司是否有合法有效的规章制度、员工是否同意以及扣款行为是否合理等因素。劳动者在遇到相关问题时应了解自己的权益，并采取适当的措施进行维权。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。