结论：公司不能因你开公司车有违章就扣发工资，你可以通过与公司协商、申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。

分析说明：

1. 工资支付义务：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。这是公司的法定义务，不得随意扣减。

2. 违章与工资扣减的关系：

   • 违章行为是你在驾驶公司车辆过程中可能违反交通规则的行为，但这并不构成公司扣发你工资的合法理由。除非劳动合同或公司规章制度中有明确约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，否则公司无权因你的违章行为而扣发工资。

3. 公司可能的主张及反驳：

   • 公司可能会主张，因你的违章行为导致公司遭受了罚款或其他经济损失，因此需要从你的工资中扣除相应金额。然而，这种主张需要满足以下条件才能成立：一是劳动合同或公司规章制度中有明确约定；二是该约定不违反法律法规的强制性规定；三是公司能够证明其实际遭受了经济损失，且该损失与你的违章行为有直接因果关系。
   • 如果公司无法满足上述条件，那么其扣发工资的行为就是违法的。

4. 你的维权途径：

   • 协商：你可以首先尝试与公司进行协商，说明公司扣发工资的行为是违法的，并要求公司立即补发工资。
   • 劳动仲裁：如果协商无果，你可以向当地的劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求公司支付被扣发的工资及可能的赔偿金。
   • 诉讼：如果对劳动仲裁结果不满意，你还可以向人民法院提起诉讼，通过法律途径来维护自己的合法权益。

行动建议：

• 收集证据：在采取任何行动之前，建议你先收集相关证据，如劳动合同、工资条、违章记录等，以证明公司扣发工资的行为及你的违章行为（如果公司主张因此扣发工资）。
• 咨询专业意见：如果你对法律程序或自己的权益不太了解，可以向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。
• 及时行动：不要拖延时间，及时采取行动来维护自己的合法权益。因为劳动争议有时效限制，逾期可能会丧失维权的机会。