关于医疗期满不胜任工作解除劳动合同的经济补偿问题，结论前置如下：

1. 合法解除时：用人单位需支付经济补偿金，并可能需支付医疗补助费。
2. 违法解除时：用人单位需支付双倍赔偿金，并可能仍需支付医疗补助费。

一、合法解除劳动合同的经济补偿

当劳动者在医疗期满后不能从事原工作，也不能胜任用人单位另行安排的工作时，用人单位有权依据《中华人民共和国劳动合同法》第四十条的规定，提前三十日以书面形式通知劳动者本人或额外支付一个月工资后解除劳动合同。在此情况下，劳动者有权获得经济补偿，具体标准如下：

• 经济补偿金的计算：
  • 按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。
  • 六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
  • 月工资是指劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。
  • 若劳动者月工资高于当地职工月平均工资三倍的，经济补偿金标准按职工月平均工资三倍的数额支付，最高不超过十二年。

计算公式：

• 经济补偿金 = 工作年限 × 月工资（或当地职工月平均工资三倍，取较低者）

示例：

• 假设劳动者在用人单位工作了5年，月工资为8000元，当地职工月平均工资为6000元，则经济补偿金为5 × 8000 = 40000元（因8000元未超过6000元的三倍，故直接按8000元计算）。
• 若劳动者月工资为20000元，当地职工月平均工资为6000元，则经济补偿金为5 × (6000 × 3) = 90000元（因20000元超过了6000元的三倍，故按三倍计算，且最高不超过十二年，此处工作年限为5年，未超限）。

二、违法解除劳动合同的赔偿

若用人单位在医疗期结束后，未遵循法定程序（如未提前通知或未支付代通知金）即解除劳动合同，或未为劳动者另行安排合适工作即解除劳动关系，均构成违法解除。此时，用人单位需承担更严厉的法律责任，即按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。

计算公式：

• 赔偿金 = 2 × 经济补偿金

示例：

• 接上例，若用人单位违法解除劳动合同，则需支付赔偿金为2 × 40000 = 80000元（或2 × 90000 = 180000元，取决于月工资是否超过当地职工月平均工资的三倍）。

三、医疗补助费

除经济补偿外，用人单位还需向因患病或非因工负伤而解除劳动合同的劳动者支付医疗补助费。这一费用在某些地区是强制性的，且对于患重病和绝症的劳动者，医疗补助费应适当增加。

• 医疗补助费的标准：
  • 一般不低于劳动者本人六个月工资收入。
  • 患重病的劳动者，增加部分不低于医疗补助费的百分之五十。
  • 患绝症的劳动者，增加部分不低于医疗补助费的百分之百。

四、特殊情况处理

• 医疗期内：劳动者仍处于医疗期内时，用人单位不得解除劳动合同。
• 特殊劳动者保护：如从事接触职业病危害作业的劳动者、因工负伤并被确认丧失或部分丧失劳动能力的劳动者、女职工在孕期、产期、哺乳期等特殊情况下的保护，用人单位在解除劳动合同时需更加谨慎，并可能面临更严格的法律责任。

五、实际操作建议

• 用人单位：在解除劳动合同时，应严格遵守法律法规，确保程序的合法性，避免违法解除带来的法律风险。同时，应充分考虑劳动者的实际情况，合理支付经济补偿和医疗补助费。
• 劳动者：应了解自己的权益，在医疗期满后若不能从事原工作或另行安排的工作，应与用人单位积极沟通，寻求合理的解决方案。必要时，可寻求法律援助以维护自身合法权益。

综上所述，医疗期满不胜任工作解除劳动合同的经济补偿问题涉及多个方面，包括合法解除与违法解除的区别、经济补偿金的计算、医疗补助费的支付以及特殊情况的保护等。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。