结论：在没有加班安排的沟通记录，但事实上已加班的情况下，申请仲裁认定的成功概率并非绝对，它取决于多种因素的综合考量，包括加班事实的证据充分性、用人单位的抗辩理由以及仲裁机构的判断等。以下是对此问题的详细分析：
一、加班事实的证据充分性
加班证据的重要性：
- 在劳动仲裁中，加班事实的认定主要依赖于劳动者提供的证据。这些证据可以包括加班通知、加班申请单、工作记录、同事证言、监控录像等。
- 如果没有加班安排的沟通记录，但劳动者能提供其他充分证据证明加班事实，如通过工作记录、同事证言或监控录像等，那么仲裁机构仍有可能认定加班事实的存在。
证据的收集与保存：
- 劳动者应尽可能收集并保存与加班相关的所有证据，包括但不限于加班通知、加班申请单（即使未获批）、工作记录、电子邮件、短信、微信聊天记录等。
- 对于电子证据，如电子邮件、短信、微信聊天记录等，应确保其完整性和真实性，必要时可以进行公证或截图保存。
二、用人单位的抗辩理由
用人单位的否认：
- 用人单位可能会否认加班事实的存在，或者主张加班是劳动者自愿的，而非用人单位安排的。
- 在这种情况下，仲裁机构会综合考虑双方提供的证据，以及加班的合理性、必要性等因素进行判断。
用人单位的规章制度：
- 如果用人单位的规章制度中明确规定了加班的审批流程、加班费的支付标准等，且劳动者未能按照规章制度提供加班证据，那么用人单位的抗辩理由可能更具说服力。
三、仲裁机构的判断
仲裁机构的自由裁量权：
- 仲裁机构在认定加班事实时，会综合考虑双方提供的证据、加班的合理性、必要性以及用人单位的规章制度等因素。
- 仲裁机构具有一定的自由裁量权，会根据具体情况进行判断。
类似案例的参考：
- 仲裁机构在处理类似案件时，可能会参考以往的类似案例和判决结果，以确保判决的公正性和一致性。
四、建议与措施
加强证据收集：
- 劳动者应尽可能收集并保存与加班相关的所有证据，以证明加班事实的存在。
- 如果可能的话，可以与同事相互印证加班事实，或者请求同事作为证人出庭作证。
了解用人单位规章制度：
- 劳动者应了解用人单位的规章制度中关于加班的规定，确保自己的加班行为符合规章制度的要求。
- 如果用人单位的规章制度存在不合理之处，劳动者可以及时向用人单位提出异议或寻求法律援助。
及时申请仲裁：
- 如果劳动者认为自己的加班权益受到侵害，应及时向劳动仲裁机构申请仲裁，以免超过仲裁时效。
- 在申请仲裁时，劳动者应提供充分的证据证明加班事实的存在，并明确自己的仲裁请求。
最后，在没有加班安排的沟通记录但事实上已加班的情况下，申请仲裁认定的成功概率并非绝对。劳动者应尽可能收集并保存与加班相关的所有证据，了解用人单位的规章制度，并在必要时及时申请仲裁以维护自己的合法权益。如果你在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。