弟弟可通过以下方式保障自身权益，但需结合具体证据和法律程序进行操作：

1. 确认宅基地使用权归属
   根据《土地管理法》第六十二条，宅基地使用权以“户”为单位申请，户内成员通常包括父母及子女。若母亲健在且未明确放弃使用权，弟弟需证明翻建行为已获得母亲书面同意（如授权委托书、翻建前家庭协议等）。若母亲未明确表态，弟弟可主张翻建系基于家庭共同决策，并提供翻建时母亲在场、参与出资或默认的证据（如邻居证言、施工记录等）。

2. 核查翻建审批手续合法性
   弟弟需提供完整的翻建审批文件（如《乡村建设规划许可证》《宅基地批准书》），证明翻建行为已获行政机关许可。若审批文件中明确记载母亲为共有人或弟弟为唯一申请人，可作为权属依据；若未记载母亲信息，需补充说明母亲未参与审批的原因（如母亲授权弟弟代为办理、母亲自愿放弃等）。

3. 区分“宅基地使用权”与“房屋所有权”
   根据《民法典》第三百六十二条，宅基地使用权不能单独继承或转让，但房屋所有权可依法继承。若翻建前宅基地上原有房屋为父母共有，姐姐可能主张对原房屋的继承权；但若翻建后房屋系弟弟出资新建，姐姐无权主张所有权，仅可能对宅基地使用权提出异议。弟弟需提供翻建资金来源证明（如银行转账记录、施工合同等），证明房屋为新建而非改建。

4. 应对姐姐起诉的策略

   • 证据收集：整理母亲健在证明（如户口本、医疗记录）、翻建审批文件、资金来源证明、家庭协商记录（如录音、聊天记录）等。
     
   • 反诉主张：若姐姐主张继承原房屋，弟弟可主张翻建行为已消灭原房屋物权，姐姐无权继承；若姐姐主张宅基地使用权，弟弟可主张母亲未明确反对翻建且实际使用房屋，应视为默认同意。
     
   • 调解优先：建议通过村委会或司法所调解，避免诉讼成本；若调解不成，需在答辩期内提交证据并申请法院现场勘验。

风险提示：若弟弟无法提供母亲同意翻建的证据，或翻建行为存在程序瑕疵（如未获审批、超面积建设），可能面临房屋被责令拆除或宅基地使用权被部分收回的风险。建议弟弟尽快固定证据，必要时委托律师协助应诉。

如有进一步细节（如母亲是否立遗嘱、翻建资金来源等），可向我补充说明，我会为您细化分析。