结论：在宅基地是儿子所有但违建由父母建造的情况下，起诉对象需根据具体情况来确定，一般可能涉及起诉父母（实际建造者）或同时涉及宅基地使用权人（儿子）的相关责任问题，具体分析如下：
从违建的实际建造者角度分析
- 法律责任主体：根据一般的法律原则，违建的实际建造者应当承担相应的法律责任。在此情况下，父母作为违建的实际建造者，是直接的侵权人或责任人。
- 起诉对象：因此，如果因违建产生了纠纷，如需要拆除违建、赔偿损失等，原则上应当起诉父母，即违建的实际建造者。
从宅基地使用权人的角度分析
- 宅基地使用权人的责任：虽然宅基地的使用权归儿子所有，但儿子作为宅基地的合法使用者，对宅基地上的建筑物有一定的管理责任。如果儿子明知父母在其宅基地上建造违建而未加以制止，或者默许、放任违建的存在，儿子也可能需要承担一定的法律责任。不过，这种责任通常是次要的，主要责任仍在父母。
- 特殊情况下的起诉对象：在某些特殊情况下，如儿子与父母共同参与了违建的建造，或者儿子从违建中获得了利益等，儿子也可能成为被起诉的对象之一。但这种情况需要具体的证据来支持。
从法律程序和实际操作的角度分析
- 确定被告：在起诉时，需要明确被告的身份。如果仅起诉父母，则需提供父母建造违建的证据；如果同时起诉儿子，则需提供儿子与违建有关联的证据。
- 法律后果：起诉后，法院将根据事实和法律进行判决。如果父母被认定为违建的实际建造者，他们可能需要承担拆除违建、赔偿损失等法律责任。如果儿子也被认定为需要承担责任，他可能需要承担相应的法律责任，但具体责任大小需根据法院的判决来确定。
建议：
- 在处理此类纠纷时，建议先尝试通过协商、调解等方式解决，以减少诉讼成本和时间。
- 如果协商、调解无果，再考虑通过法律途径解决。在起诉前，建议收集充分的证据来支持自己的主张，如违建的照片、视频、证人证言等。
- 如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。