结论：员工孕期，用人单位不可以依据劳动合同发生重大变化为由发放最低工资标准。此行为违反了相关法律法规对女职工孕期的特殊保护规定。
法律背景与规定
女职工特殊保护：
- 根据《中华人民共和国劳动法》、《女职工劳动保护特别规定》及《中华人民共和国妇女权益保障法》等法律法规，女职工在怀孕、生育、哺乳期间享有特殊的劳动保护，用人单位不得降低其工资、予以辞退或与其解除劳动（聘用）合同。
劳动合同变更与工资调整：
- 劳动合同的变更，包括工作岗位、薪资待遇等，应当遵循协商一致的原则。用人单位不得单方面变更劳动合同内容，尤其是降低女职工在孕期的工资。
- 即使劳动合同中存在关于“劳动合同发生重大变化时，用人单位可以调整工资”的条款，该条款在女职工孕期也不得适用，因为这与法律法规对女职工的特殊保护相冲突。
可能的法律后果
用人单位责任：
- 如果用人单位在女职工孕期单方面降低其工资，女职工有权向劳动保障部门投诉或举报，要求用人单位补发工资差额。
- 女职工还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，若对仲裁结果不满意，可依法向人民法院提起诉讼，要求用人单位承担相应的法律责任。
女职工权益维护：
- 女职工在遭遇此类问题时，应保留好相关证据，如工资条、劳动合同、调岗通知等，以便在维权时提供有力支持。
- 女职工可以积极与用人单位协商，寻求和解；协商无果时，及时寻求法律援助或咨询专业律师，通过合法途径维护自身权益。
实际建议
用人单位：
- 用人单位应严格遵守相关法律法规，确保女职工在孕期的合法权益不受侵犯。
- 在女职工孕期，用人单位应尽量避免调整其工作岗位和薪资待遇，如确需调整，应与女职工协商一致，并确保其工作条件和薪资待遇不低于原岗位或劳动合同约定的标准。
女职工：
- 女职工在孕期应了解自己的合法权益，如遭遇用人单位违法降薪等行为，应勇于维权。
- 女职工可以通过向劳动保障部门投诉、申请劳动仲裁或提起诉讼等方式维护自身权益，同时也可以寻求法律援助或咨询专业律师以获取更专业的帮助。
总结：员工孕期，用人单位不得依据劳动合同发生重大变化为由发放最低工资标准。女职工在孕期享有特殊的劳动保护，用人单位应严格遵守相关法律法规，确保女职工的合法权益不受侵犯。如遇此类问题，女职工应积极维权，通过合法途径寻求解决。有问题可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。