结论：若医生明确建议休息三个月且该休息期被认定为停工留薪期，工厂应当按照您受伤前的工资标准支付这三个月的工资作为赔偿；若未被认定为停工留薪期，工厂可能无需直接支付这三个月的工资，但您仍可享受其他工伤保险待遇。以下为详细分析：
一、关于停工留薪期的认定与工资支付
停工留薪期的定义：
- 停工留薪期是指职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的期间。在此期间，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。
停工留薪期的确定：
- 停工留薪期一般根据医疗机构的诊断证明和工伤职工的实际情况来确定。医生明确建议休息三个月，这通常会被视为停工留薪期的一个重要参考。
- 但具体停工留薪期的长度还需由劳动能力鉴定委员会进行确认，或者根据当地工伤保险条例的具体规定来确定。
工资支付义务：
- 若三个月休息期被认定为停工留薪期，工厂应当按照您受伤前的工资标准支付这三个月的工资。这是工厂的法定义务，不得以任何理由拒绝支付。
二、若未被认定为停工留薪期的情况
工厂的责任：
- 如果三个月休息期未被认定为停工留薪期，工厂可能无需直接支付这三个月的工资。但这并不意味着工厂没有其他责任。
其他工伤保险待遇：
- 即使未被认定为停工留薪期，您仍可享受其他工伤保险待遇，如医疗费用报销、一次性伤残补助金（如果构成伤残）等。
三、实际操作建议
与工厂沟通：
- 首先，建议您与工厂的人力资源部门或相关负责人进行沟通，明确医生建议的休息期是否被认定为停工留薪期，并了解工厂的具体支付计划。
申请劳动能力鉴定：
- 如果工厂对停工留薪期的认定存在异议，您可以向当地的劳动能力鉴定委员会申请鉴定，以确定具体的停工留薪期长度。
寻求法律援助：
- 如果工厂拒绝支付停工留薪期内的工资或其他工伤保险待遇，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师（即向我咨询），以维护自己的合法权益。
四、法律依据
- 根据《工伤保险条例》第三十三条：“职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。”
五、注意事项
- 在处理此类纠纷时，请务必保留好所有相关的医疗证明、工资单、劳动合同等证据材料，以便在需要时提供证明。
- 工伤赔偿问题可能因地区和具体政策而有所不同，因此建议您在处理时结合当地的工伤保险条例和具体政策进行操作。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。