结论：公司员工手册中规定“吃饭时间不让出去”是否合法，需结合具体情况判断，主要看该规定是否违反法律法规的强制性规定，以及是否侵犯了员工的合法权益。以下从不同角度进行分析：
从法律法规的强制性规定角度：
- 我国《劳动法》及相关法律法规并未明确规定员工在吃饭时间必须享有外出自由。但是，这些法律法规强调了劳动者享有休息休假的权利，以及用人单位应当保障劳动者在劳动过程中的安全和健康。
- 如果员工手册中的规定过于严苛，导致员工在吃饭时间无法得到充分的休息，或者影响了员工的正常生理需求（如无法外出购买食物、药品等），那么该规定可能因违反法律法规的立法精神而无效。
从员工合法权益的角度：
- 员工在工作时间之外，包括吃饭时间，应当享有一定的自由。如果员工手册中的规定限制了员工在吃饭时间的自由，且没有合理的理由（如出于安全考虑、工作需要等），那么该规定可能侵犯了员工的合法权益。
- 员工有权拒绝执行不合理的规定，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
从公司管理的合理性角度：
- 公司制定员工手册的目的是为了规范员工行为，提高工作效率。但是，如果规定过于严苛或不合理，可能会适得其反，导致员工不满和抵触情绪。
- 公司应当考虑员工的实际需求和感受，制定合理、人性化的规定。例如，可以规定员工在吃饭时间可以在公司内部或指定区域活动，或者允许员工在特定条件下外出。
建议：
- 如果您认为员工手册中的规定不合理或侵犯了您的合法权益，您可以先与公司进行沟通协商，表达您的意见和诉求。
- 如果沟通协商无果，您可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
- 在处理此类问题时，建议您保留好相关证据（如员工手册、沟通记录等），以便在需要时提供证明。
可能后果：
- 如果员工手册中的规定被认定为违法或不合理，公司可能需要修改规定，并可能面临劳动监察部门的处罚或员工的赔偿诉求。
- 如果员工因违反不合理规定而受到处罚，员工有权通过法律途径维护自己的权益，并可能获得相应的赔偿。
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