结论：是否合理需分情况讨论，主要取决于公司规章制度的具体规定以及该规定的合法性、合理性。具体分析如下：
若公司规章制度明确规定未请假且未出勤属于旷工，并明确旷工的扣分或处罚措施，且该制度经过民主程序制定并公示或告知员工：
- 在这种情况下，公司依据规章制度对员工星期天未去上班且未请假的行为进行扣分，通常是合理的。因为员工有义务遵守公司的规章制度，而公司也有权依据合法有效的制度对员工进行管理。
- 但需要注意的是，即使制度有规定，扣分的幅度或处罚的严重性也应当与员工的违纪行为相适应，不能过分苛刻或显失公平。
若公司规章制度未明确规定未请假且未出勤的扣分措施，或者该制度未经过民主程序制定、未公示或告知员工：
- 在这种情况下，公司对员工星期天未去上班且未请假的行为进行扣分，可能缺乏合法依据。因为员工对于未被告知或未经过民主程序制定的制度，没有遵守的义务。
- 如果公司因此扣分或采取其他处罚措施，员工有权提出异议，并可以要求公司纠正不当行为。
另外，还需要考虑星期天是否属于员工的正常休息日：
- 如果星期天是员工的正常休息日，且员工没有违反公司关于休息日的相关规定（如未经批准不得在休息日工作等），那么公司因员工未去上班而扣分显然是不合理的。
- 如果星期天并非员工的正常休息日，或者员工虽然享有休息日但违反了公司关于休息日工作的相关规定，那么公司依据规章制度进行扣分可能是合理的。