结论：该员工现在主张一次性医疗补助金可能面临较大困难，但并非完全没有机会，具体情况需结合当地规定和实际情况判断。

1. 时效性问题：
   • 一般来说，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。该员工离职三年后才主张一次性医疗补助金，从时效角度看，很可能已经超过了法定的仲裁时效期间。不过，如果存在一些特殊情况，比如不可抗力或者其他正当理由导致其未能及时主张权利，时效可能会中止或中断，但需要员工提供充分的证据来证明。
2. 一次性医疗补助金的支付条件：
   • 一次性医疗补助金通常是在员工因工致残被鉴定为五级至十级伤残，与用人单位解除或者终止劳动关系时，由工伤保险基金支付（未参保的由用人单位支付）。该员工在离职时没有主张，现在离职三年后再来主张，需要看当地对于这种情况是否有特殊规定。有些地方可能规定，在特定条件下，即使离职一段时间后，员工仍可以主张相关待遇，但这种情况比较少见且通常有严格限制。
3. 实际操作建议：
   • 对于该员工来说，首先可以尝试与公司协商，看公司是否愿意支付一次性医疗补助金。如果协商不成，可以向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，但在仲裁过程中，公司很可能会以超过时效为由进行抗辩。如果仲裁不受理或者仲裁结果不利，员工还可以向法院提起诉讼，但同样需要面对时效等问题的挑战。
   • 对于公司而言，如果员工前来主张一次性医疗补助金，要仔细审查员工的主张是否符合法律规定和当地政策，同时关注时效问题。如果认为员工的主张不成立，要积极收集证据进行抗辩。

总之，这种情况比较复杂，涉及到时效、支付条件等多个方面的问题。如果员工或公司有进一步的疑问或需要更具体的法律帮助，可以直接向我咨询。