结论：综合工时制下“上六休一，一天工作6.5小时”的合法性取决于多个因素，包括是否获得劳动行政部门批准、综合计算周期内的总工时是否超标以及加班补偿是否到位。以下是对此问题的详细分析：

1. 综合计算工时工作制的合法性基础：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，对于不能实行标准工时制度的企业，经劳动行政部门批准，可以实行综合计算工时工作制。这种制度以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，只要综合计算周期内的总实际工作时间不超过法定标准，即视为合法。

2. 具体工时安排的分析：

   • 在您描述的情况下，如果“上六休一”且每天工作6.5小时，那么一周的总工时为39小时（6.5小时/天 × 6天），这明显低于标准工时制下的44小时上限。然而，这并不意味着这种安排一定合法，因为还需要考虑综合计算周期内的总工时是否超标。
   • 如果企业实行的是综合计算工时工作制，并且已经获得了劳动行政部门的批准，那么只要在一个综合计算周期内（如一个月、一个季度或一年）的总工时不超过法定标准，这种“上六休一”的安排就是合法的。

3. 加班补偿的考虑：

   • 即使总工时未超标，但如果存在加班情况（即超出标准工时制下的每日8小时或每周44小时），企业仍需依法支付加班费。在您描述的情况下，如果某天或某周的工作时间超过了标准工时，那么超出部分应视为加班，企业应支付相应的加班费。
   • 加班费的具体标准为：延长工作时间支付不低于工资的150%的工资报酬；休息日工作且不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬。

4. 劳动者权益保护：

   • 劳动者有权了解自己的工作时间和加班情况，并有权获得相应的报酬和休息。如果劳动者认为工作时间超标或未获应有报酬和休息，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

建议：

• 对于企业而言，应确保实行综合计算工时工作制时已经获得劳动行政部门的批准，并严格按照批准的综合计算周期和总工时安排工作。同时，应依法支付加班费，保障劳动者的合法权益。
• 对于劳动者而言，应了解自己的工作时间和加班情况，并保留好相关证据（如考勤记录、工资单等）。如果认为自己的权益受到侵害，可以及时向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

可能后果：

• 如果企业未获得劳动行政部门批准而擅自实行综合计算工时工作制，或者综合计算周期内的总工时超标且未依法支付加班费，那么这种安排就是违法的。企业可能面临劳动监察部门的处罚，并需要向劳动者支付相应的赔偿。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。