结论前置：员工起诉公司不按约定进行专项奖励，公司需根据具体情况积极应对，包括核实奖励约定、收集证据、与员工协商或参与诉讼等。以下从多个角度详细分析：
一、核实专项奖励约定
合同审查：
- 公司应首先审查与员工签订的劳动合同、补充协议或相关规章制度中，是否明确约定了专项奖励的发放条件、标准、时间等关键要素。
- 若合同或制度中有明确约定，公司需确认是否已满足发放条件，以及是否存在违反约定未发放的情况。
约定变更：
- 若公司曾对专项奖励的约定进行过变更，需确保变更过程合法合规，且已得到员工的认可或同意。
- 未经员工同意，公司单方面变更奖励约定可能构成违约。
二、收集证据
发放记录：
- 公司应收集并整理与专项奖励发放相关的所有记录，包括但不限于发放通知、转账凭证、员工签字确认单等。
- 这些证据将有助于证明公司是否已按照约定履行了发放义务。
员工表现：
- 若专项奖励的发放与员工的工作表现或业绩挂钩，公司还需收集员工的工作表现评价、业绩考核结果等证据。
- 这些证据将用于证明员工是否满足发放专项奖励的条件。
三、与员工协商
沟通协商：
- 在收到员工的起诉后，公司可主动与员工进行沟通协商，了解员工的诉求和不满原因。
- 通过协商，双方可能达成和解协议，从而避免进一步的法律纠纷。
和解协议：
- 若双方达成和解协议，公司应确保协议内容合法合规，并明确双方的权利和义务。
- 和解协议一旦签订，即具有法律效力，双方应严格遵守。
四、参与诉讼
应诉准备：
- 若协商无果，公司需积极准备应诉材料，包括答辩状、证据清单等。
- 公司应委托专业律师进行代理，以确保在诉讼过程中能够充分维护自身权益。
诉讼过程：
- 在诉讼过程中，公司需按照法院的要求参加庭审、提交证据等。
- 公司应积极配合法院的调查和调解工作，以争取最有利的诉讼结果。
判决执行：
- 若法院判决公司需向员工支付专项奖励，公司应按时履行判决义务。
- 若公司拒不履行判决，员工可申请法院强制执行，这将对公司造成不良影响。
五、法律后果与预防措施
法律后果：
- 若公司被法院判决需向员工支付专项奖励而未履行，公司可能面临罚款、列入失信被执行人名单等法律后果。
- 这将影响公司的信誉和形象，甚至可能对公司的正常运营造成不利影响。
预防措施：
- 为避免类似纠纷的发生，公司应完善相关规章制度，明确专项奖励的发放条件、标准、时间等关键要素。
- 公司应加强与员工的沟通协商，确保员工对奖励约定有充分的理解和认可。
- 公司应定期对奖励发放情况进行审查和监督，确保奖励发放的合法性和合规性。
最后建议：面对员工起诉公司不按约定进行专项奖励的情况，公司应保持冷静和理性，积极应对并寻求专业法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。