结论：全部门都加班，就针对你们3个不加班实行5天8小时工作制，这一做法是否合理，需结合具体情况来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、从公司规章制度和劳动合同的角度
若公司规章制度或劳动合同中有明确规定：
- 如果公司的规章制度或者与员工签订的劳动合同中明确规定了加班的相关条款，比如哪些情况下需要加班、加班的补偿方式等，并且这些规定或条款是合法有效的（即不违反法律法规的强制性规定），那么公司有权根据这些规定或条款来安排加班。
- 在此情况下，如果公司要求全部门加班，而你们3人因不符合加班条件（如已达到加班时长上限、有特殊事由等）或选择不加班，且公司按照规章制度或劳动合同给予了相应的处理（如不安排加班不算旷工、不扣减工资等），那么公司的做法可能是合理的。
若公司规章制度或劳动合同中无明确规定：
- 如果公司的规章制度或劳动合同中没有明确规定加班的相关条款，或者规定不明确、不合法，那么公司单方面要求全部门加班可能缺乏法律依据。
- 在此情况下，如果公司仅针对你们3人不加班而实行5天8小时工作制，而其他加班的员工则享受加班工资或其他补偿，这种做法可能构成对你们的不公平对待，从合理性角度讲是存疑的。
二、从法律法规的角度
加班的强制性：
- 根据《劳动法》等相关法律法规，用人单位由于生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
- 这意味着，加班并非强制性的，而是需要与劳动者协商一致，并且受到一定时长的限制。因此，如果公司未经协商单方面要求加班，或者加班时长超过了法定限制，那么公司的做法是不合法的。
不公平对待的禁止性：
- 法律法规禁止用人单位对劳动者进行不公平对待。如果公司仅针对你们3人不加班而实行不同于其他员工的待遇（如降低工资、减少福利等），这种做法可能构成不公平对待，违反了法律法规的禁止性规定。
三、建议与行动
与公司沟通：
- 首先，建议你们与公司进行沟通，了解公司要求加班的具体原因和依据，以及为何仅针对你们3人不加班实行5天8小时工作制。
- 通过沟通，你们可以更好地了解公司的立场和意图，同时也可以表达自己的诉求和关切。
审查公司规章制度和劳动合同：
- 仔细审查公司的规章制度和与你们签订的劳动合同，了解其中关于加班的条款和规定。
- 如果发现公司的规章制度或劳动合同中存在不合法或不合理的条款，可以向公司提出异议或寻求法律援助。
寻求法律援助：
- 如果你们认为公司的做法侵犯了你们的合法权益，如不公平对待、未支付加班工资等，可以向当地的劳动监察部门投诉或寻求法律援助。
- 专业的法律人士可以帮助你们分析情况、提供法律建议，并协助你们维护自己的合法权益。
总之，全部门都加班就针对你们3人不加班实行5天8小时工作制是否合理，需结合具体情况来判断。如果你们对此有疑问或担忧，建议及时与公司沟通并寻求法律援助。