结论：职工被公安立案后，公司是否有理由不发其绩效，不能一概而论，需根据具体情况判断。
分析如下：
公安立案的性质与影响：
- 公安立案通常意味着职工可能涉及刑事犯罪，但这并不直接等同于职工有罪。在法律上，未经法院判决，任何人不得被认定为有罪。
- 立案本身并不构成公司不发绩效的直接理由。公司需要依据相关法律法规和内部规章制度，以及职工的具体行为表现来决定是否发放绩效。
公司规章制度与劳动合同：
- 公司应首先审查其规章制度和劳动合同中关于绩效发放的规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了职工在涉及刑事案件时的绩效处理方式，公司应按照这些规定执行。
- 如果规章制度或劳动合同中没有相关规定，公司则不能随意停发绩效。此时，公司应基于职工的实际工作表现、出勤情况等因素来综合判断是否发放绩效。
职工的实际工作表现：
- 即使职工被公安立案，但如果其实际工作表现未受影响，且完成了工作任务，公司应按照约定发放绩效。
- 如果职工因被立案而无法正常工作，或者其工作表现受到严重影响，公司可以根据实际情况考虑调整或停发绩效。但这一决定应基于合理、公正的原则，并确保有充分的证据支持。
法律后果与风险：
- 如果公司无正当理由停发职工绩效，可能构成违法解除劳动合同或拖欠工资等违法行为，职工有权向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，要求公司支付绩效工资及可能的赔偿金。
- 因此，公司在决定是否停发绩效时，应谨慎评估法律风险，并确保有充分的法律依据和证据支持其决定。
建议：
- 对于公司而言，在职工被公安立案后，应首先了解立案的具体原因和性质，评估其对职工工作表现的影响。
- 同时，公司应审查其规章制度和劳动合同中关于绩效发放的规定，确保有明确的处理依据。
- 在做出决定前，公司应与职工进行充分沟通，了解其实际情况和诉求，并尽量达成共识。
- 如果公司决定停发绩效，应确保有充分的证据支持其决定，并准备好应对可能的法律纠纷。
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