结论：借用他人营业执照的个体工商户未与员工签订劳动合同，在双方存在事实劳动关系且发生劳动争议时，员工完全可以申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。以下从多个角度为你详细分析：

个体工商户的法律地位与责任

个体工商户作为个体经济组织，在雇佣员工时必须遵守我国相关的劳动法规。根据《中华人民共和国劳动合同法》第二条，中华人民共和国境内的企业、个体经济组织等组织（以下称用人单位）与劳动者建立劳动关系，订立、履行、变更、解除或者终止劳动合同，适用本法。这意味着，即便个体工商户是借用他人营业执照经营，其依然属于合法的用人单位主体，自用工之日起即与劳动者建立劳动关系，应当订立书面劳动合同。若未签订，且双方存在事实上的劳动关系，劳动者的权益仍受法律保护。

事实劳动关系的认定

事实劳动关系是指即使没有签订书面劳动合同，但双方实际上已经按照劳动关系的标准履行了相应的权利和义务。这种关系可以通过多种证据来证明，包括但不限于：

• 工资支付记录（如银行转账明细、工资条）
• 工作证、服务证
• 考勤记录
• 同事证言
• 与个体工商户负责人的聊天记录（涉及工作安排、工资协商等内容）
• 工作成果（如销售记录、生产的产品等）

只要你能收集到上述证据中的部分或全部，就有可能证明你与个体工商户之间存在事实劳动关系。

劳动仲裁的适用条件与流程

1. 适用条件：当个体工商户与劳动者之间出现劳动争议，如工资报酬、工作时间、休息休假、劳动保护、社会保险等方面的纠纷，且双方存在事实劳动关系时，劳动者可以申请劳动仲裁。
2. 申请流程：
   • 劳动者需向劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请书及相关证据。
   • 仲裁机构会根据双方提交的证据及相关法律规定进行审理。
   • 若认定存在事实劳动关系且个体工商户存在违法行为（如未签订劳动合同），仲裁机构会依法作出裁决，要求个体工商户承担相应的法律责任，如支付未签劳动合同的双倍工资差额（最多11个月）等。

申请劳动仲裁时需注意的问题

• 证据收集：由于未签订劳动合同，你应特别注意收集能够证明劳动关系存在的证据，以确保在仲裁过程中能够有力支持自己的主张。
• 仲裁时效：劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，你应及时行使自己的权利，避免超过时效期间。

其他维权途径

除了申请劳动仲裁外，你还可以选择以下方式来维护自己的合法权益：

• 与个体工商户进行协商，寻求和解。
• 向当地劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。

最后提醒，借用他人营业执照经营本身可能涉及违法违规行为，但这并不影响你作为劳动者的合法权益。在维权过程中，你应充分了解相关法律法规，积极收集证据，并及时采取行动以确保自己的权益得到有效保护。如果你在维权过程中遇到任何问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。