结论：请半天假扣全勤是否合理，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及请假是否符合公司规定等因素。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度与劳动合同约定：
- 规章制度合法性：首先，需要查看公司的规章制度中是否有关于全勤奖和请假扣款的具体规定。如果公司规章制度中明确规定了请半天假会扣除全勤奖，并且该规章制度是经过民主程序制定、公示或告知劳动者的，那么这种规定在法律上是有效的。
- 劳动合同内容：其次，要检查劳动合同中是否有相关约定。如果劳动合同中明确规定了全勤奖的发放条件和扣除情形，包括请半天假会扣除全勤奖，那么双方应按照劳动合同的约定执行。
请假是否符合公司规定：
- 请假流程：如果员工按照公司规定的请假流程进行了申请，并且得到了批准，但公司仍然扣除全勤奖，这可能涉及不公平对待或违反公司规定的问题。
- 特殊情况：如果员工因特殊情况（如突发疾病、家庭紧急事务等）需要请假，且这些情况符合公司规章制度或劳动合同中的例外条款，那么公司不应扣除全勤奖。
法律原则与合理性：
- 公平原则：从法律原则的角度来看，公司扣除全勤奖应当遵循公平、合理的原则。如果扣除全勤奖的金额过高或扣除条件过于苛刻，可能违反公平原则。
- 合理性判断：合理性判断需结合具体情况，如公司全勤奖的金额、员工请假对工作的影响程度等。如果员工仅请半天假且未对工作造成显著影响，而公司却扣除全额全勤奖，这种做法可能缺乏合理性。
建议与行动：
- 与公司沟通：如果员工认为公司扣除全勤奖的做法不合理，首先可以尝试与公司进行沟通，了解扣除全勤奖的具体原因和依据，并寻求解决方案。
- 申请劳动仲裁：如果沟通无果，员工可以向当地劳动仲裁机构申请劳动仲裁，要求公司返还被扣除的全勤奖。在申请劳动仲裁时，员工需要提供相关证据，如公司规章制度、劳动合同、请假记录等。
示例说明：
假设某公司规章制度中规定：“员工请事假超过半天，将扣除当月全勤奖。”如果员工请了半天事假，但公司仍然扣除其全勤奖，那么这种做法可能违反了公司规章制度中的明确规定。员工可以与公司沟通或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
后续思考：
员工在面对公司扣除全勤奖的情况时，应首先了解公司规章制度和劳动合同中的相关约定，并评估公司扣除全勤奖的合理性和合法性。如有必要，可以寻求法律帮助来维护自己的权益。同时，公司也应制定合理、公平的规章制度和劳动合同条款，以避免类似纠纷的发生。
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