关于请半天假是扣底薪还是扣全勤的问题，结论前置如下：
- 是否扣全勤奖：主要取决于公司的规章制度。如果公司规章制度明确规定请假半天会扣除全勤奖，并且该制度已经过民主程序制定且向劳动者公示告知，那么扣除是合理的。反之，若公司没有相关规定或规定不明确，从公平合理角度出发，仅因请假半天就扣除全勤奖则缺乏依据。
- 是否扣底薪：通常情况下，请半天假不会直接导致底薪的扣除。底薪是劳动者提供正常劳动后应得的固定报酬，除非劳动者存在严重违反公司规章制度或劳动合同约定的行为，否则公司不得随意扣除底薪。
详细分析如下：
全勤奖的扣除
全勤奖是公司为了鼓励员工全月无缺席而设立的一种额外奖励制度，不属于工资范畴，而是公司对员工出勤表现的奖励。因此，其发放与否、发放标准等均由公司根据自身情况自行决定。
- 有明确规定的情况：如果公司规章制度明确规定请假半天会扣除全勤奖，并且该制度已经通过合法程序制定并公示，那么员工在请假半天后，公司有权按照规定扣除全勤奖。
- 无明确规定或规定不明确的情况：若公司规章制度中没有明确规定请假半天会扣除全勤奖，或者规定存在模糊之处，从公平合理和保护劳动者权益的角度出发，公司不应仅凭请假半天就扣除员工的全勤奖。此时，员工可以与公司进行沟通，要求按照实际情况处理全勤奖问题。
底薪的扣除
底薪是劳动者提供正常劳动后应得的固定报酬，是劳动合同中约定的基本工资部分。通常情况下，请半天假不会直接导致底薪的扣除，因为劳动者在半天内仍然提供了部分劳动。除非劳动者存在以下情形，否则公司不得随意扣除底薪：
- 严重违反公司规章制度：如旷工、迟到早退等严重违反公司出勤制度的行为。
- 违反劳动合同约定：如劳动合同中明确约定了请假超过一定时长将扣除底薪的条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定。
法律依据与建议
- 法律依据：根据《劳动部关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第五十三条，劳动法中的“工资”是指用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给劳动者的劳动报酬。全勤奖作为额外奖励，不属于工资范畴，其发放与否及标准由公司自行决定。但这一决定必须建立在合法合规的基础上，不能侵犯劳动者的合法权益。
- 建议：
- 员工应了解公司规章制度：在请假前，员工应仔细阅读公司的规章制度，了解请假对全勤奖和底薪的具体影响。
- 沟通与协商：如果对公司规章制度有疑问或不满，员工可以通过与人力资源部门沟通、协商等方式解决。
- 保护自身权益：在任何情况下，公司都不得因员工请假而扣减其应得的工资（不含全勤奖等额外奖励）。如果公司违规操作，员工可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁维护自己的合法权益。
综上所述，请半天假是否扣全勤奖和底薪主要取决于公司的规章制度和劳动合同的约定。员工在请假前应充分了解公司规定，并在必要时与公司进行沟通协商以保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。