结论：公司体检扣半天工资是否合理，需根据具体情况判断，一般情况下，若体检属于公司福利且未占用员工休息时间，公司不应扣工资；若体检占用员工休息时间或公司有明确规章制度且已告知员工，则可能合理，但需符合法律规定。以下从不同角度详细分析：
一、体检属于公司福利且未占用员工休息时间
法律背景：
- 根据《劳动法》及相关规定，员工享有获得劳动报酬的权利，公司不得无故克扣员工工资。
- 若体检是公司提供的福利，且安排在正常工作时间之外（如周末或员工休息日），但并未占用员工的实际休息时间（例如，员工可以选择是否参加，且不参加不影响工资），则公司扣工资的行为可能缺乏法律依据。
法律建议：
- 员工可以与公司沟通，了解扣工资的具体原因，并要求公司提供相关规章制度或法律依据。
- 若公司无法提供合理依据，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
二、体检占用员工休息时间
法律背景：
- 若体检安排在员工的休息时间（如周末或法定节假日），且公司要求员工必须参加，则可能构成对员工休息权的侵犯。
- 在这种情况下，公司如果扣工资，可能涉及双重侵权：既侵犯了员工的休息权，又无故克扣了工资。
法律建议：
- 员工可以与公司协商，要求公司将体检安排在正常工作时间，或者给予相应的调休或加班费。
- 若公司拒绝协商或无法提供合理解决方案，员工同样可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
三、公司有明确规章制度且已告知员工
法律背景：
- 若公司有明确的规章制度，规定体检属于员工义务，且扣工资是制度的一部分，同时该制度已经通过合法程序（如职工代表大会或工会讨论通过）并告知员工，则公司扣工资的行为可能具有合法性。
- 但即便如此，公司也需确保规章制度的内容不违反法律法规的强制性规定，且扣工资的幅度需合理。
法律建议：
- 员工应仔细审查公司的规章制度，了解扣工资的具体条款和依据。
- 若认为规章制度不合理或违法，员工可以向公司提出异议，并要求公司修改或废除相关条款。
- 若公司拒绝修改或废除，员工可以通过法律途径维护自己的权益。
四、特殊情况下的考虑
- 自愿参加体检：如果体检是自愿参加的，且公司未强制要求员工参加，那么公司扣工资的行为可能缺乏合理性。员工可以选择不参加体检，以避免工资被扣。
- 工资构成与扣除方式：员工还需关注自己的工资构成和扣除方式。如果工资中包含了与体检相关的福利费用（如体检费），且公司因员工未参加体检而扣除这部分费用，那么这种扣除可能是合理的。但即便如此，公司也需提前告知员工，并确保扣除的金额与实际费用相符。
最后，公司体检扣半天工资是否合理，需根据具体情况判断。员工在遇到此类问题时，应首先与公司沟通了解原因，并审查公司的规章制度和法律法规。若认为公司的行为违法或不合理，员工可以通过法律途径维护自己的权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。