结论：公司因您喝醉后第二天无法上班而扣除全勤奖的做法是否合法，需根据具体情况判断，包括公司规章制度、劳动合同约定以及您缺勤的具体原因等。
分析如下：
公司规章制度与劳动合同：
- 首先，要查看公司的规章制度以及您与公司签订的劳动合同中是否有关于全勤奖扣除的具体规定。如果规章制度或劳动合同中明确规定了因个人原因（包括但不限于醉酒导致无法上班）缺勤将扣除全勤奖，且该规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司扣除全勤奖的行为可能是合法的。
- 反之，如果规章制度或劳动合同中没有此类规定，或者规定不明确，那么公司单方面扣除全勤奖的行为可能缺乏合法依据。
缺勤原因与责任：
- 喝醉后第二天无法上班，虽然属于个人行为导致的缺勤，但也要考虑缺勤的具体原因和责任。如果是因为个人娱乐、社交等非工作原因导致的醉酒，且该行为并未违反公司规章制度或法律法规，那么公司扣除全勤奖的行为可能显得过于严苛。
- 然而，如果醉酒行为已经违反了公司规章制度（如禁止在工作日饮酒过量）或法律法规（如醉酒驾驶等），那么公司扣除全勤奖作为纪律处分的一部分，可能是合理的。
法律法规的强制性规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》等相关法律法规，公司不得随意扣除员工的工资或奖金，除非有明确的法律依据或合同约定。因此，在扣除全勤奖之前，公司需要确保其行为符合法律法规的强制性规定。
建议：
- 与公司沟通：首先，您可以与公司的人力资源部门或上级领导进行沟通，了解扣除全勤奖的具体原因和依据，并表达自己的观点和诉求。
- 查看规章制度与合同：仔细查看公司的规章制度和劳动合同，了解其中关于全勤奖扣除的具体规定，以便更好地维护自己的权益。
- 寻求法律援助：如果您认为公司的行为违反了法律法规或合同约定，且无法与公司达成一致意见，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果公司的行为合法且合理，您可能需要接受扣除全勤奖的事实，并调整自己的行为以避免类似情况再次发生。
- 如果公司的行为违法或不合理，您有权通过法律途径维护自己的权益，包括要求公司补发全勤奖、赔偿损失等。
总之，公司因您喝醉后第二天无法上班而扣除全勤奖的做法是否合法，需根据具体情况判断。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。