结论：宫外孕自然流产不做手术，在私企上班一般应按病假处理，不应按事假扣除工资，但具体还需结合公司规章制度及实际情况判断。

分析说明：

1. 病假与事假的区别：

   • 病假：通常指员工因患病或非因工负伤需要停止工作进行医疗和休息的假期。在病假期间，员工享有相应的病假工资或医疗期待遇。
   • 事假：则是指员工因个人原因需要请假的假期，如处理私事、参加家庭活动等。事假期间，公司通常不支付工资。

2. 宫外孕自然流产的性质：

   • 宫外孕自然流产属于非因工负伤的医疗情形，员工需要停止工作进行休息和恢复。因此，从性质上看，这种情况更符合病假的定义。

3. 法律法规依据：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费等待遇。
   • 虽然该规定未直接提及宫外孕自然流产，但宫外孕自然流产属于非因工负伤的范畴，因此应适用该规定的相关精神。

4. 公司规章制度的影响：

   • 尽管法律法规对病假有明确规定，但具体执行时还需结合公司的规章制度。如果公司规章制度中明确规定了宫外孕自然流产等情形应按病假处理，则员工应享受病假待遇。
   • 如果公司规章制度未明确规定，但根据法律法规的精神和病假的定义，员工也有权要求按病假处理。

5. 实际操作建议：

   • 员工方面：在发生宫外孕自然流产等情形时，应及时向公司说明情况，并提供相关医疗证明，以便公司按病假处理。
   • 公司方面：应完善公司规章制度，明确病假和事假的定义及适用范围，确保在处理类似情况时有章可循。同时，也应尊重员工的合法权益，按照法律法规和公司规章制度的规定支付病假工资或疾病救济费。

后续行动建议：

• 如果公司坚持按事假处理，员工可以与公司进行沟通协商，说明宫外孕自然流产的性质及法律法规的相关规定，争取按病假处理。
• 如果沟通无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

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