结论：公司制度未经工会但进行全员意见征询和公示，其合法性需分情况讨论，不能一概而论。

分析：

1. 工会的作用与制度制定的合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条的规定，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
   • 这意味着，工会或职工代表在制度制定过程中应起到协商和参与的作用。如果公司制度未经工会讨论，但直接进行了全员意见征询和公示，这在一定程度上可能缺乏了工会这一关键协商环节。

2. 全员意见征询和公示的效力：

   • 全员意见征询和公示是公司制度制定过程中的一种民主参与方式，它有助于确保制度的透明度和员工的知情权。
   • 然而，仅凭全员意见征询和公示，并不能完全替代工会或职工代表的协商作用。因为工会或职工代表在协商过程中能够更全面地反映员工的利益和诉求，确保制度的公平性和合理性。

3. 合法性的具体判断：

   • 如果公司制度在制定过程中，虽然未经工会讨论，但已经通过全员意见征询和公示充分听取了员工的意见，并且这些意见在制度中得到了合理体现，那么该制度在一定程度上可能仍然具有合法性。
   • 但如果公司制度在制定过程中完全忽视了工会的角色，且没有充分听取和考虑员工的意见，那么该制度可能因缺乏民主参与和协商而面临合法性挑战。

建议：

• 对于公司：在制定涉及员工切身利益的规章制度时，应尽可能遵循法定程序，包括与工会或职工代表进行协商。如果确实无法与工会协商，也应确保通过全员意见征询和公示等方式充分听取员工的意见，并确保这些意见在制度中得到合理体现。
• 对于员工：如果认为公司制度在制定过程中存在违法或不合理之处，可以向公司提出异议或向劳动监察部门投诉。同时，也可以积极寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。

后续行动：

• 如果你或你的同事认为公司制度在制定过程中存在问题，或者该制度已经对你们的权益造成了影响，可以直接向我咨询具体的法律问题和应对策略。我将根据你们的实际情况，提供专业的法律意见和帮助。