您好，关于您提到的“公司入职要所有证件原件留存是否正常”的问题，我可以明确地告诉您，这种情况是不正常的，且可能涉及违法行为。

首先，根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条的规定，用人单位在招用劳动者时，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，也不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。这意味着，任何单位和个人都没有权利扣留他人的证件原件。

其次，“扣证件”往往是一种典型的求职陷阱。有些用人单位或中介机构可能会以保管或经办社会保险、申办工资卡等业务名义，试图扣押求职者的身份证、毕业证、学位证等个人证件原件。这种行为不仅侵犯了求职者的合法权益，也可能给求职者带来不必要的麻烦和风险。

因此，我建议您在遇到这种情况时，要果断拒绝并保护好自己的证件原件。如果公司确实需要您提供某些证件的复印或影印件，您可以在合适的位置注明具体用途，并确保这些复印件不会被用于非法目的。同时，您也可以向公司明确表达您的担忧和立场，即您不愿意将证件原件交付给他人保管。

最后，如果您在求职过程中遇到了任何违法行为或侵权行为，都可以及时向有关部门进行举报投诉。例如，您可以拨打12333热线电话，或者直接向用工所在地的劳动保障监察机构进行举报投诉。

希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。