公司无权长期保管员工的毕业证原件，员工应拒绝这一要求。

一. 公司无权扣押毕业证原件

• 根据相关法律规定，用人单位不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件。毕业证原件作为个人的重要学历证明，属于个人证件范畴，公司无权长期保管或扣押。

二. 公司查看毕业证原件的合理情形

• 公司有权在入职环节要求员工提供毕业证原件以供查验，以核实员工的学历信息。但查验完成后，公司应立即归还毕业证原件给员工，不得无故扣留。

三. 员工的应对措施

• 如果公司强行要求员工上交毕业证原件进行保管，员工有权明确拒绝，并可以向公司说明法律规定，要求公司立即归还毕业证原件。
• 如果公司因员工拒绝上交毕业证原件而对其进行不合理的处理，如解雇、降薪等，员工可以通过合法途径维护自己的权益，包括与公司协商、向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁等。

四. 建议与注意事项

• 员工在入职时，应仔细阅读劳动合同和公司的相关规章制度，确保自己的合法权益不受侵害。
• 如果公司确实需要员工的毕业证信息，员工可以考虑提供毕业证复印件或相关证明，并在合适位置注明具体用途，以防止证件被滥用。
• 员工应妥善保管好自己的毕业证原件，避免遗失或损坏。

综上所述，公司无权长期保管员工的毕业证原件，员工应坚决拒绝这一要求，并了解自己的权利与应对措施，以便在必要时维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。