跨部门工作本身并不直接违反劳动法，但是否违法需结合具体情况判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、从劳动合同的角度分析

劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确规定了劳动者的工作岗位、工作内容或工作地点，而用人单位未经劳动者同意，单方面要求劳动者跨部门工作，且这种跨部门工作实质上改变了劳动合同中约定的工作岗位或工作内容，那么用人单位的行为可能构成违约。

• 法律依据：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。
• 建议：在这种情况下，劳动者有权拒绝用人单位的跨部门工作要求，并可以要求用人单位按照原劳动合同履行义务。如果用人单位坚持要求劳动者跨部门工作，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

二、从工作安排合理性的角度分析

如果用人单位的跨部门工作安排是合理的，比如是为了应对临时性的工作任务、提高工作效率或促进员工全面发展等，且这种安排没有给劳动者带来实质性的不利影响（如降低工资、增加工作强度等），那么这种跨部门工作安排通常是合法的。

• 合理性判断：合理性判断主要考虑工作安排的必要性、临时性、对劳动者的影响等因素。如果工作安排是长期的、固定的，且实质上改变了劳动者的工作岗位或工作内容，那么这种安排可能缺乏合理性。
• 建议：在这种情况下，劳动者可以与用人单位进行沟通协商，表达自己的意见和诉求。如果沟通无果，劳动者也可以考虑向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，但需要提供充分的证据证明用人单位的跨部门工作安排缺乏合理性。

三、从特殊保护的角度分析

对于某些特殊岗位的劳动者，如女职工在孕期、产期、哺乳期的，或者劳动者处于医疗期内的等，用人单位的跨部门工作安排可能需要受到更多的限制。

• 法律依据：根据《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及相关法律法规的规定，对于这些特殊岗位的劳动者，用人单位需要给予特殊的保护，不得随意变更其工作岗位或工作内容。
• 建议：如果劳动者属于这些特殊岗位的人员，且用人单位的跨部门工作安排可能对其造成不利影响，那么劳动者有权拒绝这种安排，并可以要求用人单位按照相关法律法规的规定给予特殊的保护。

四、实际操作中的注意事项

1. 保留证据：无论劳动者选择接受还是拒绝用人单位的跨部门工作安排，都应当注意保留相关证据，如劳动合同、工作安排通知、沟通记录等，以备不时之需。
2. 及时沟通：如果劳动者对用人单位的跨部门工作安排有异议，应当及时与用人单位进行沟通协商，表达自己的意见和诉求。
3. 寻求法律援助：如果劳动者与用人单位之间的争议无法通过沟通协商解决，劳动者可以寻求法律援助或向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

总结来说，跨部门工作本身并不直接违反劳动法，但是否违法需结合劳动合同的约定、工作安排的合理性以及劳动者的特殊保护需求等因素进行综合判断。如果你对跨部门工作安排有疑问或担忧，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。